Bioconductor Code: basecallQC

Raw Blame Patch Log History
Sample_Project,Lane,Sample_ID,Sample_Name,Index,Index2,FCID,SampleRef,Description,Control,Recipe,Operator
AZNF,1,Sample_1,NA,TGACCA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,1,Sample_1,NA,ACAGTG,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,1,Sample_1,NA,GCCAAT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,1,Sample_1,NA,CTTGTA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,2,Sample_2,NA,TGACCA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,2,Sample_2,NA,ACAGTG,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,2,Sample_2,NA,GCCAAT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,2,Sample_2,NA,CTTGTA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,3,Sample_3,NA,TGACCA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,3,Sample_3,NA,ACAGTG,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,3,Sample_3,NA,GCCAAT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,3,Sample_3,NA,CTTGTA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,4,Sample_4,NA,TGACCA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,4,Sample_4,NA,ACAGTG,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,4,Sample_4,NA,GCCAAT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AZNF,4,Sample_4,NA,CTTGTA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,5,n1_0,NA,ACAGTG,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,5,n1_20,NA,GCCAAT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,5,n2_30T3,NA,CTTGTA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,5,n2_15,NA,GTGAAA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,5,n3_50,NA,CGATGT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,5,n3_11,NA,CAGATC,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,6,n1_5,NA,ACAGTG,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,6,n1_30,NA,GCCAAT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,6,n2_0,NA,CTTGTA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,6,n2_20,NA,GTGAAA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,6,n3_30T3,NA,CGATGT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,6,n3_15,NA,CAGATC,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,7,n1_11,NA,ACAGTG,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,7,n1_50,NA,GCCAAT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,7,n2_5,NA,CTTGTA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,7,n2_30,NA,GTGAAA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,7,n3_0,NA,CGATGT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,7,n3_20,NA,CAGATC,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,8,n1_15,NA,ACAGTG,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,8,n1_30T3,NA,GCCAAT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,8,n2_11,NA,CTTGTA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,8,n2_50,NA,GTGAAA,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,8,n3_5,NA,CGATGT,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA
AYLC,8,n3_30,NA,CAGATC,NA,CAL6PANXX,NA,NA,NA,NA,NA