3.目录
个人数据集下载步骤:
1. 因为数据集比较大,所以要先下载Aspera插件才能进行下载(安装Aspera插件若非美国用户要把美式英语添加到语言列表),如果是要用大量数据集进行训练,可以直接在云端访问: 数据集已经上传在Amazon Simple Storage Service (S3) bucket中。
2. 设置好Aspera的下载位置之后登录ConnectomeDB,
选择感兴趣的数据集,例如1200这个数据集,点击右上角:
就可以选择类别,例如选择的是3TMRI数据集:
之后加入下载队列即可下载。
本文下载的是7TMRI的结构化处理数据集,但是得到的文件还是3TMRI的(可能是官方的问题吧)
解压文件夹之后有两类文件,一类是压缩包,命名规则是“编号 + _3T_Structural_1.6mm_preproc.zip”,代表不同被试者的高分辨率预处理包,
字段 | 含义 |
---|---|
SubjectID |
被试编号(如 100610、102311) |
3T |
数据是在 3T 磁共振设备上采集的(不是 7T) |
Structural |
结构像(T1w、T2w) |
1.6mm |
空间分辨率为 1.6 mm 各向同性 |
preproc |
已完成 HCP 标准预处理(去噪、偏差场校正、颅骨剥离、配准等) |
另一类是md5文件,用来验证下载的完整性,
例:在终端输入:md5sum -c 995174_3T_Structural_1.6mm_preproc.zip.md5,输出ok表示文件完整。
解压其中一个压缩包,得到:
一共有三个包,分别是原始空间的加权结构像和配准到标准空间后的结构像,以及说明文件。
名称 | 作用 |
---|---|
T1w/ | 被试 995174 的 原始空间 T1 加权结构像(已做颅骨剥离、偏差场校 |