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RSS订阅原创 任务三 datawhale AI夏令营
根据siRNA与mRNA的结合位置和方式的不同，沉默机制会有所不同：siRNA与mRNA的3′非翻译区（UTR）结合时，在Ago1、Ago3和Ago4的帮助下会导致翻译抑制；除此之外，GC含量也是siRNA效率中的一个关键参数。此外，反义链中第2到第7个核苷酸和第8到第18个核苷酸的GC百分比分别为19%和52%是理想的。功能性siRNA在第9到第14个核苷酸之间存在一个不稳定区域，被称为能量谷，这种内部的不稳定性通过在mRNA剪切过程中诱导最理想的构象，从而提高了RISC复合体的功能性。
2024-08-03 23:11:39
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原创 Datawhale AI 夏令营 task 2
可以将序列特征转化为表格问题，并进行特征工程。首先，通过值的分布或唯一值数量确定类别型变量，例如对gene_target_symbol_name变量进行one-hot编码。最后，使用LightGBM等回归模型进行训练，如设定boosting_type为gbdt，objective为regression，metric为root_mean_squared_error等，通过训练数据进行模型训练并验证。通过这些方法，从多个维度对原始数据进行特征提取与转化，增强模型的表达能力和预测性能，提高得分。
2024-07-31 23:42:29
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原创 Datawhale AI 夏令营 task 1 笔记打卡
形成后，siRNA与一种称为RNA诱导的沉默复合物（RNAinduced silencing complex, RISC）的多蛋白组分复合物结合。在RISC复合物中，siRNA链被分离，具有更稳定的5′末端的链通常被整合到活性RISC复合物中。然后，反义单链siRNA组分引导并排列在靶mRNA上，并通过催化RISC蛋白（Argonaute family（Ago2））的作用，mRNA被切割，即对应基因被沉默，表达蛋白能力削弱。Datawhale AI 夏令营 task 1 笔记打卡。RNA干扰（RNAi）
2024-07-28 23:06:48
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空空如也
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