gold的博客

本文介绍了一种将并行程序的I/O访问模式转换为字符串表示，并利用核函数进行比较的方法。通过将I/O访问模式转化为树结构并生成字符串表示，使用Kast Spectrum核函数计算字符串间的相似度，从而实现对模式的聚类分析。实验结果表明，该方法能够有效地区分不同的I/O访问模式，并为优化系统性能提供参考。

本文介绍了Globalizer软件系统和一种新颖的I/O访问模式分析技术。Globalizer基于信息统计理论，通过多级维度缩减和并行计算方案，高效解决耗时的多极值全局优化问题，并能充分利用现代高性能计算系统。I/O访问模式分析方法则通过字符串转换技术和Kast Spectrum Kernel核函数，将复杂的I/O行为转化为加权字符串表示，从而有效识别并行程序的I/O模式特征。这两种技术分别在优化计算和行为分析方面具有重要应用价值，并可在高性能计算环境中综合应用，以提升系统整体性能。

本文提出了一种基于拥塞博弈的高通量虚拟药物筛选调度算法，旨在解决药物研发中数据集过大和结果冗余的问题。通过引入拥塞博弈模型，将计算节点视为博弈玩家，任务块作为策略选择，以最大化整体效用为目标，构建了高效的调度策略。算法在基于BOINC的桌面网格系统上实现，并通过实验验证了其在早期发现‘命中’分子和保持化学多样性方面的显著优势。研究涵盖了理论模型构建、算法实现、实验设置与分析，以及未来研究方向探讨，为高通量虚拟筛选提供了新的方法支持。

本文综述了并行计算在直径约束网络可靠性分析和基于桌面网格的高通量虚拟药物筛选调度中的研究进展。首先，针对直径约束网络可靠性（DCNR）这一NP难问题，讨论了其计算复杂性及传统方法的局限性，并重点介绍了改进的分解方法（CPFM）及其在分布式内存超级计算机上的高效并行实现。其次，探讨了虚拟药物筛选中任务调度面临的挑战，提出了一种基于拥塞博弈调度的数学模型，以优化筛选效率与化学多样性之间的平衡。通过案例研究和实验分析，验证了CPFM在并行计算中的高效性以及所提出调度模型在药物筛选中的有效性。最后，对未来的研究方向

本文探讨了数据挖掘算法并行化的功能方法，并介绍了其在网络可靠性并行计算中的应用。基于函数组合形式和伯恩斯坦条件，提出了一种理论正确且易于实现的并行化方法。通过将算法分解为功能挖掘块（FMB），并使用parallel函数实现数据并行和任务并行，有效提升了1R算法在多核环境下的性能。此外，还讨论了在网络可靠性计算中如何利用并行方法解决NP难问题。实验结果表明，不同并行变体在大规模数据集上具有良好的扩展性和效率。

本文探讨了高效优化与并行数据挖掘算法的研究，重点介绍了多准则全局优化算法及其并行化扩展，以及数据挖掘算法并行化的功能方法。通过数值实验验证，MPMGA 算法在迭代次数、Pareto 域近似点数量、超体积指数和分布均匀性指数等方面均表现出显著优势。此外，提出的功能方法为数据挖掘算法的并行化提供了灵活且高效的支持，克服了传统方法的局限性。这些算法和方法在工程设计、资源分配、经济决策等领域具有广泛的应用前景。

本文探讨了可扩展计算与多准则优化问题的并行求解方法。重点分析了GeRa代码在超级计算机上的可扩展性表现，以及时间消耗型多准则优化问题的高效并行策略。通过加速比实验、并行效率分析和实际应用案例，展示了并行计算在降低计算成本、提高搜索效率方面的显著优势。同时，文章展望了并行计算与人工智能融合、跨平台分布式计算的发展趋势，为未来复杂优化问题的解决提供了方法参考和工具支持。

本文介绍了基于INMOST软件平台的GeRa数值代码在放射性废物安全处置中的水文地质建模应用。GeRa代码支持3D非结构化网格、并行化计算和多种物理化学过程的模拟，包括地下水流动、反应性传输、化学反应和放射性衰变等。文章通过在多核笔记本、INM RAS集群和Lomonosov超级计算机上的实验，评估了GeRa的并行性能，比较了不同线性求解器（如PETSc、BIILU2）的效率，并分析了化学模型、地质模型和传输模型的可扩展性。实验结果表明，GeRa具备良好的并行效率和可扩展性，能够高效处理大规模复杂问题。

本文探讨了云应用与服务流量管理优化及物联网分布式数据融合的相关技术与应用。针对云服务流量管理，提出了基于‘最短跨度优先’算法的QoS自适应控制方法，有效优化了路由规划和负载均衡，减少了响应时间和故障数量。在物联网方面，设计了一种基于复杂事件处理（CEP）的分层多级数据融合架构，结合边缘计算范式，解决了数据传输量受限、延迟高等问题，并展示了其在智能城市、工业物联网和智能家居等领域的广泛应用前景。

本文探讨了虚拟数据中心中云应用与服务的流量管理优化方法。通过构建软件定义基础设施的多层模型，提出了一种自适应路由算法和云应用数据分配算法，以优化用户请求的响应时间和资源利用率。实验结果表明，所提出的算法能够有效降低响应时间、提高系统性能和可靠性。此外，文章还对比分析了传统流量路由方法与所提算法的优势，并展望了未来的研究方向。

本文探讨了基于蚁群优化（ACO）和模拟退火（SA）混合算法的并行化元启发式方法，用于多产品批量工厂的最优设备选择设计。通过在CPU-GPU异构平台上实现ACO搜索初始解与SA进一步优化的两阶段策略，有效解决了大规模组合优化问题。实验表明，该混合算法在解的质量和运行时间上均优于传统分支限界法，尤其在大规模问题中展现出显著的加速效果和接近全局最优的解。文章还分析了关键参数对算法性能的影响，并展望了未来在算法改进、问题扩展和硬件优化等方面的发展方向。

本文探讨了并行优化算法在多领域的应用，重点分析了并行索引方法在解决约束全局优化问题中的高效性，以及混合元启发式方法（结合蚁群优化和模拟退火）在多产品批量工厂设计中的优化实践。通过数值实验展示了并行化带来的显著加速效果，并深入解析了混合方法在搜索效率和解的质量方面的优势。

本文探讨了作业调度中的拍卖方法与并行约束全局优化算法的原理、实验分析及应用前景。在作业调度方面，比较了英式拍卖与首价密封拍卖两种模型的性能，通过实验评估了其在资源分配效率、作业处理时间及中断次数等方面的表现。在并行约束全局优化算法方面，介绍了基于索引方法的并行求解策略，克服了传统惩罚函数的局限性，并通过多处理器协同处理提升了求解效率。文章进一步分析了两种方法在资源分配中的关联性，提出了实际应用建议，并展望了未来在智能化调度与自适应并行策略等方面的发展趋势。

本文探讨了分布式计算中的作业调度算法对比与拍卖方法的应用。通过对比预期调度算法（ANT）和回填算法（BF），实验表明ANT能够在考虑用户和虚拟组织（VO）偏好的同时，提供与BF相近的调度性能。此外，文章还介绍了地理分布式系统（GDS）的架构和基于拍卖方法的分散调度算法，分析了第一价格密封投标拍卖和英式拍卖在作业调度中的操作流程与性能评估。最后，文章总结了在实际应用中需要注意的系统异构性、拍卖方法局限性以及调度算法优化方向，为分布式计算作业调度提供了理论依据和实践指导。

本文提出了一种基于循环调度方案的预期调度方法，旨在解决网格虚拟组织中用户与组织利益相关者之间相互矛盾的偏好问题。该方法通过寻找作业执行的替代方案、选择最优替代方案组合以及进行可行的资源分配三个步骤，结合AEP算法和执行相似性标准，实现了在资源有限的分布式计算环境中高效、公平的调度。实验结果表明，该方法在多个优化问题上表现出色，能够根据不同的用户效用限制在VO和用户标准之间进行平衡，并具有较好的资源适应性和调度准确性。

本文介绍了优化LuNA程序执行的控制程序生成算法，旨在提高大规模数值模型在超级计算机上的并行编程效率。通过引入基于事件驱动的LuNAFW框架和自动化生成控制程序的算法，显著提升了LuNA程序的性能，实验表明其性能相比原有LuNA版本提高平均达40%，接近MPI的高效表现。

本文介绍了一种基于SMP/NUMA架构的‘核心岛方法’，用于优化异构模板计算（如MPDATA）的效率。通过结合(3 + 1)D分解和额外计算策略，该方法在多处理器环境下显著提升了性能，同时保持了良好的稳定性和资源利用率。文章详细分析了其执行机制、性能优势及应用场景，并展望了未来的研究方向。

本文探讨了并行计算中的两种优化策略：一是基于UPC的Mapreduce框架在WordCount应用中的性能表现，通过遗传算法优化洗牌阶段提升效率；二是针对SMP/NUMA架构下MPDATA科学应用的优化，采用(3+1)D分解和核心岛方法显著减少内存数据传输，提高计算性能。文章总结了不同架构下的优化方法，并展望了未来并行计算的发展方向。

本文研究了异构计算系统中的工作流调度算法，通过SimGrid模拟框架对九种主流算法进行了全面比较，实验表明静态算法在考虑任务依赖和网络竞争时表现更优，动态算法可能因忽略依赖关系而降低整体性能。同时，文章提出了一种基于UPC语言的新型MapReduce框架，利用PGAS模型和共享哈希映射结构优化数据交换和负载均衡，采用遗传算法减少通信开销并提升并行效率。研究为调度算法设计和大数据处理框架优化提供了理论支持与实践参考。

本文系统研究了多种工作流调度算法，包括静态调度算法如HEFT、HCPT、Lookahead和PEFT，以及动态调度算法如OLB、MCT、Min-Min、Max-Min和Sufferage。通过仿真实验，比较了不同算法在不同工作流特性（如并行性和通信与计算比率CCR）以及不同网络环境下的性能表现。实验结果表明，静态算法在低并行性、低CCR工作流中表现优异，而动态算法在高并行性或高CCR工作流中更具优势。文章最后提出了基于工作流特性的算法选择建议，并展望了未来的研究方向，如改进网络模型、混合调度策略和自适应调度

本博客主要探讨了分布式系统中的概率因果消息排序机制和异构计算系统中的工作流调度算法。在概率因果消息排序部分，研究提出了一种降低因果广播通信成本的机制，通过合理的密钥分配和理论错误分析，在允许一定错误率的前提下优化消息传递顺序。实验表明，参数K存在最优值，能够最小化错误率。在工作流调度算法部分，研究基于SimGrid仿真框架对九种先进算法进行了全面比较，证实了HEFT和Lookahead算法在最小化总完成时间方面的优势，并揭示了简单网络模型的不足。研究为分布式系统消息排序和异构系统任务调度提供了新的思路和方法

本文探讨了大规模数值模型中的数据分配算法与分布式系统中的概率因果广播机制。首先对比了 Patch 和 Rope 两种数据分配算法在均匀与非均匀分布下的性能，结果显示 Patch 算法在迁移距离和负载均衡方面更具优势。随后介绍了一种适用于大规模系统的概率因果广播机制，通过使用较小的向量时钟和概率方法，降低了通信成本并提高了可扩展性。文章分析了该机制的优势与挑战，并展望了其未来优化方向与应用场景。

本文详细解析了在大规模数据处理中至关重要的两项技术：并行数据缩减操作和分布式算法Patch。前者通过结合CPU与GPU的并行计算能力，显著提升了数据去重和压缩的吞吐量，适用于SSD主存储系统的空间优化；后者通过多维数据网格的智能映射和动态负载均衡机制，有效减少了分布式环境中的通信开销，提高了资源利用率。文章还通过实验对比了Patch与传统Rope算法的性能表现，并展望了未来可能的优化方向和技术应用前景。

本文提出了一种基于多核CPU和GPU的并行数据缩减技术，用于优化主存储系统的内联数据缩减操作。通过在CPU和GPU上分别实现并行化的数据去重和压缩方法，并根据性能特点合理分配任务，有效提升了数据缩减的吞吐量。实验结果表明，该技术在去重、压缩以及集成数据缩减方面分别提升了15.0%、88.3%和89.7%的性能。

本文提出了一种基于参数化秒表自动机网络（NSA）的模块化系统操作通用模型，旨在解决现有可调度性分析方法在建模精度和计算复杂度上的不足。该模型通过形式化定义系统配置、自动机构成及通信机制，能够准确生成系统操作轨迹，并支持自动化验证。同时，文章通过‘观察者’方法和UPPAAL验证器对组件模型的正确性进行了自动检查，并手动证明了整体模型的正确性和确定性，确保了模型在可调度性分析中的有效性和可靠性。

本文探讨了科学计算与模块化计算机系统的高效解决方案与分析模型。首先介绍了HPCSOMAS框架，它结合多智能体系统与面向服务技术，用于优化异构分布式计算环境中的资源分配与执行控制，并通过ABCSW工具实现应用程序到计算服务的自动化转换。此外，还提出了一种基于秒表自动机的可调度性分析模型，适用于模块化计算机系统，具有广泛适用性、正确性保障和高效分析能力。这些技术为科学计算资源利用与模块化系统调度提供了创新思路和实践方案。

本文介绍了一种基于领域知识的可扩展科学应用自动化开发方法，重点包括对LuNA系统的GPU支持扩展以及提出高性能计算服务导向多智能体系统（HPCSOMAS）框架。通过LuNA系统的工作负载分配算法，有效优化了CPU与GPU之间的计算分配，减少了程序执行时间。HPCSOMAS框架则提供了一种自动化方式，将应用程序转化为可在异构分布式计算环境中运行的服务导向Web应用。文章还展示了框架的架构、应用示例及其优势与挑战，为未来高性能计算领域的科学计算和资源利用提供了新的思路。

本文探讨了并行计算中的重叠与优化技术以及方面编程语言中执行顺序的定义。通过结合并行化与重叠放置技术，显著提升了高斯-赛德尔迭代方法的并行效率，实验表明其加速比超过线性加速比的1.8倍。同时，方面编程语言利用碎片化方法和明确的控制方案定义，实现了高度的非过程性，显著提高了矩阵LU分解等任务的性能与可扩展性。研究还分析了相关技术的应用场景、优化方向及未来发展趋势。

本研究围绕保守并行离散事件仿真算法（PDES）和并行计算优化展开。在PDES部分，通过引入小世界网络中的长距离连接，分析其对算法同步性和可扩展性的影响，发现该方法在大规模系统仿真中具有良好的性能。在并行计算优化方面，结合超平面方法、迭代空间分解和缓存内存优化技术，有效提升了程序性能。研究还探讨了PDES在计算机网络、电力系统和生物系统模拟中的潜在应用，并对未来并行计算优化的方向如超平面方法改进、数据布局创新和并行策略拓展进行了展望。

本文介绍了新型最小四态部分射击小队同步问题（FSSP）的解决方案，包括对称与非对称的四态同步协议及其时间复杂度和特性。同时，分析了保守并行离散事件模拟（PDES）算法在不同网络模型下的性能表现，如规则网络、小世界网络以及Freeze-and-Shift模型。文章还探讨了影响PDES性能的关键因素以及未来的研究方向，如数组的四态同步方案和混合网络模型下的模拟算法，为大规模并行模拟技术提供了理论支持和实践指导。

本博客围绕细胞自动机及其在同步问题和波干涉模拟中的应用展开研究。首先介绍了细胞自动机的基本概念，包括细胞状态、模型密度和全局状态。详细探讨了 HPP1rp 细胞自动机的运行机制，并通过模拟两波干涉展示了其在物理过程建模中的作用。此外，深入研究了射击小队同步问题（FSSP），包括完整解决方案和部分解决方案，并提出了一类新的四状态 FSSP 协议，可同步长度为 n 2^k - 1 的一维环形细胞自动机。文章还讨论了 CA 干涉的碎片化算法实现，并对 LuNA 程序的性能优化进行了分析。未来的研究方向包括算法优

本文探讨了细粒度并行粒子群优化（FGP-PSO）算法和细胞自动机波干涉在并行编程环境中的实现与性能。FGP-PSO通过OpenMP和MPI等并行化策略在多核和众核架构上显著提高了优化效率。同时，LuNA碎片化编程系统为并行编程提供了新的思路，简化了节点间通信和资源管理的复杂性。通过结合这两种技术，有望在实际工程问题中实现更高效的解决方案。

本研究探讨了细胞自动机（CA）模型与粒子群优化（PSO）算法的并行实现及其在高性能计算中的应用。CA模型用于模拟大型碳样本的腐蚀过程，并通过并行计算加速实验。同时，提出了一种细粒度并行PSO策略（FGP-PSO），适用于高维复杂优化问题，并在多核处理器及集群上实现。研究验证了模型与算法的有效性，并探讨了其在不同场景下的性能表现与应用前景。

本博客探讨了多精度计算库和碳腐蚀模拟的研究进展。多精度计算库基于RNS（剩余数系统）实现，支持混合CPU-GPU并行计算，具有良好的并行化能力，但存在无法动态增加精度的局限性。碳腐蚀模拟采用细胞自动机（CA）方法，能够有效模拟质子交换膜燃料电池中碳载体的腐蚀过程，结合MPI库实现并行化，提高了模拟效率。同时，文章分析了多精度计算的内存开销和并行实现中的性能瓶颈，并提出了未来的研究方向，包括RNS基扩展算法的开发和并行效率优化。

本文探讨了二维细胞自动机的分类方案及其基于无限单位公理和grossone的应用，同时介绍了一款用于并行CPU-GPU架构的多精度残数算术库MPRES。分类方案通过分析自动机的混沌程度，将其分为A、B、C三类，为理解自动机行为提供了新的视角。MPRES库基于残数系统（RNS）实现了高效的多精度计算，支持扩展范围浮点格式、多精度模整数格式和模-位置浮点格式，适用于卫星碰撞模拟、分数阶微分方程求解等高精度需求场景。文章还分析了MPRES在CPU和GPU上的实现机制及其面临的挑战，并展望了未来在优化算法和扩展功能方

本文研究了二维元胞自动机的分类问题，并结合 Sergeyev 的无限单位公理提供了一种新的计算方法。文章详细阐述了二维元胞自动机的定义、配置空间、度量结构以及动力学行为，基于正向迭代的匹配配置数量，将二维元胞自动机划分为三个类别：类别 A（最有序）、类别 B（中等混乱）和类别 C（最混乱）。通过引入无穷小量和无限单位 ①，文章构建了处理无限和无穷小对象的数学工具，并应用于元胞自动机的度量分析和分类流程中。这种分类方法有助于深入理解二维元胞自动机的演化行为，为并行计算、复杂系统模拟等领域的应用提供了理论基础。

本博文围绕浅水域窒息现象的预测建模与二维元胞自动机的分类研究展开，重点探讨了亚速海等浅水域因水华现象引发鱼类窒息死亡的机理，并构建了水动力与生物动力学耦合的数学模型。研究采用卫星数据提高建模精度，并基于改进交替三角法（MATM）实现高效的并行求解，提升了预测准确度。在二维元胞自动机方面，引入无限单元公理和grossone理论，建立新的非阿基米德度量，通过开圆盘点数计算和前向动力学分析，提出了基于配置数量的分类方案。研究为浅水域生态环境保护与复杂系统建模提供了理论支持与实践工具。

本文详细探讨了蒸汽轮机中的热传输数学模型及其软件实现方法。基于热传导方程，结合第三类边界条件和实际初始条件，建立了适用于蒸汽轮机的热传输模型。通过引入均匀网格离散化方法和单元格占用系数，模型在空间上具有二阶误差精度，并通过优化权重方案显著提升了计算效率。采用改进的交替三角迭代方法（MATM）求解网格方程，并通过并行实现进一步提高计算速度。数值实验验证了模型在蒸汽轮机关键功能点上的热模式变化，结果表明模型具有良好的稳定性和准确性。研究结果为蒸汽轮机的设计、优化和运行提供了理论支持和实用工具。

本文探讨了基于树状网格的隐式计算流体动力学（CFD）求解器的并行算法实现，并介绍了蒸汽轮机热力过程数学模型的软件开发。研究重点包括使用树状自适应网格细化（AMR）方法处理复杂几何形状，开发适用于大规模并行系统的图着色算法，以及基于LU-SGS隐式方案的高效并行计算策略。同时，针对蒸汽轮机中的热流不均匀问题，构建了考虑复杂几何的数学模型，并开发了相应的软件实现方案。研究成果在设计优化、设备寿命延长及多领域应用方面具有重要价值。

本文分析并评估了现代编译器（包括Intel C/C++、GCC C/C++、LLVM/Clang和PGI C/C++）在英特尔64和英特尔至强融核架构下的循环自动向量化能力。通过ETSVC测试套件对编译器未能有效向量化的循环类别进行了识别和分类，并比较了不同编译器在不同数据类型和循环结构下的向量化效果及加速比。结果显示，Intel C/C++表现最佳，LLVM/Clang效果最差，而包含复杂控制流和特定惯用语的循环仍是自动向量化的难点。