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pingu的生信备忘录
公主号:pingu的生信备忘录,分享关于pingu的生信技能和知识
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sklearn|机器学习:决策树(一)
决策树(Decision Tree)是一种非参数的有监督学习方法,非参数指不限制数据的结构和类型,有监督学习则指必须具有标签。决策树能够从一系列有特征和标签的数据中总结出决策规则,并用树状图的结构来呈现,可用于解决分类和回归问题,其算法本质是一种图结构。其他以树模型为核心的集成算法还有随机森林、AdaBoost。以上为基于西瓜好坏问题构建的决策树,其中最初问题所在地方为根结点(没有进边,有出边,包含最初针对特征的提问),得到结论前的每一个问题为中间节点。原创 2024-10-31 20:06:39 · 2165 阅读 · 2 评论 -
可变剪切因子 motif 分析
数据库(http://cisbp-rna.ccbr.utoronto.ca/)信息,并从中提取对应剪切因子的 motif,其中 MEME 中提供了。MEME 工具含有多个 motif 数据库,具体可用数据库可参看:https://meme-suite.org/meme/db/motifs。界面(https://meme-suite.org/meme/tools/fimo)上传对应文件即可完成对应靶序列上的 motif 扫描。ASF 的 motif 主要结合在 gene 的 intro 区域,负责可变剪切。原创 2024-10-23 17:12:36 · 1693 阅读 · 0 评论