贝叶斯地理统计模型R-INLA-1

最新推荐文章于 2024-03-27 18:05:13 发布
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贝叶斯地理统计模型INLA

本次博客主要讲述如何使用R-INLA软件进行空间分析，通过随机嵌套偏微分方程方法和集成的嵌套Laplace渐进法可为潜在高斯随机场模型中的边际分布提供准确而有效的估计。近年来已经广泛应用于空间流行病学领域。

由于笔者水平有限，关于理论部分，可前往link，针对数学公式及理论部分，这里不赘述，简化数学公式，强调如何应用，及在R语言里面如何实现。

安装INLA包

INLA官网The R-INLA project
如果在R里面下载速度非常慢，可以去 Index source 下载最新版Windows R-INLA 3.6里面，直接下载安装包

# 稳定版
 install.packages("INLA", repos=c(getOption("repos"), INLA="https://inla.r-inla-download.org/R/stable"), dep=TRUE)
 
#测试版
install.packages("INLA", repos=c(getOption
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贝叶斯地理统计模型R-INLA-3
学习中
01-04 1058
贝叶斯地理统计模型R-INLA-3
R-INLA-参数介绍
学习中
01-05 1393
在前述的内容中，我们介绍了，如何利用海拔高度预测降雨量信息，在建立了INLA空间模型后，需要对模型的参数进行提取，但是具体涉及到哪些参数，所以本篇内容就来介绍，INLA模型中包含的参数问题。
贝叶斯地理统计模型R-INLA-2
学习中
01-04 733
一般线形模型来拟合降雨量与海拔高度之间的关系，并对。接下来我们将介绍如何测试模型的好坏及与。首先我们将367个点绘制出来，看一下效果。空间位置，来估计研究区域内的降雨量。个空间效应给提取出来 然后整合放在。个位置的拟合值与实际值的相关系数为。模型预测的结果很不理想。上一期我们介绍了，如何利用。虽然我们已经将数据集分成。跟前面介绍的一样，写好。
r-inla
03-29
自述文件 该存储库包含R-INLA项目的源代码。 见 可以从下载R-INLA软件包的预编译版本。 霍瓦尔街
安装INLA命令
完美主义者的博客
07-28 4079
R中安装INLA命令 控制栏输入以下命令： install.packages("INLA", repos=c(getOption("repos"), INLA="https://inla.r-inla-download.org/R/stable"), dep=TRUE)
4: The R-INLA package-----2019 Geospatial Health Data-Modeling and Visualization with R-INLA and Shi
完美主义者的博客
02-05 3520
4.2 .The inla() function inla()函数是用来调整模型的。inla()的主要参数如下。 formula：指定线性预测器的公式对象。 data：包含数据的数据框。如果我们希望预测某些观测值的响应变量，我们需要将这些观测值的响应变量指定为NA。 family：字符串或字符串的向量，表示似然族，如高斯、泊松或二项式。默认情况下，族是高斯族。输入names(inla.models()$likelihood)可以看到可能的替代列表，输入inla.doc(“familyname”)
R语言贝叶斯网络模型、INLA下的贝叶斯回归、R语言现代贝叶斯统计学方法、R语言混合效应（多水平/层次/嵌套）模型
WangYan2022的博客
12-22 2591
贝叶斯网络不但能够统合已有的各种统计学方法，如混合回归模型，LASSO,自回归模型，隐马模型等等；而且在很大程度上能够弥补统计学模型不能够进行因果推断的缺憾。以开源的R语言为平台，通过理论和实践相结合的方法，系统介绍了贝叶斯网络结构学习，参数学习以及因果推断等全过程，对贝叶斯网络有较全面的了解，并能够用于科研和工作实践中。
贝叶斯时空模型-INLA-4
学习中
01-05 2643
该文章中，会简化数学计算的过程，主要是针对，在有数据的基础上，如何应用贝叶斯时空模型，找出影响因素，绘制时间变化的空间分布预测图。上述中关键一步与前几期介绍的不一样的地方是，我们加入了n.group参数，用来指定年份，先看一下Year有多少年的，然后封装在s.index里面。在前述的内容中，我们介绍了，如何处理空间的数据，利用海拔高度预测降雨量的例子。建立好数据及mesh以后，我们现在写INLA公式，如果不考虑残差项，那就是固定效应，现在我们增加残差项，及空间与时间效应。这里的Mesh设定值为10，20。
R语言INLA包最新安装方法
weixin_39360177的博客
10-04 1万+
install.packages("INLA",repos=c(getOption("repos"),INLA="https://inla.r-inla-download.org/R/stable"), dep=TRUE) 或 install.packages("INLA",repos=c(getOption("repos"),INLA="https://inla.r-inla-download.org/R/testing"), dep=TRUE) 需要先安装Rgraphviz if (!requ
2.4 Making maps with R --INLA处理地理空间健康数据
完美主义者的博客
02-04 1324
地图对于传达地理空间信息非常有用。在此，我们介绍一些简单的例子，展示一些常用的软件包的使用。 在R中常用于制图的一些包，即ggplot2、leaflet、mapview和tmap。在本书的其余部分，我们将展示如何使用ggplot2和leaflet包创建更复杂的地图，以可视化几个应用程序的结果。 2.4.1 ggplot2 ggplot2（https://ggplot2.tidyverse.org/）是一个基于图形的语法来创建图形的包。这意味着我们可以使用ggplot()函数和以下元素来创建一个图。 我们
R 语言的安装教程
知识搬运者
09-16 2万+
注意：先安装R，再安装Rstudio等，软件的安装路径不能有中文。注：我安装时，上述三个软件全部安装在同一个目录。然后选择与上面下载的R版本相对应的版本即可。注意：安装目录不能是中文路径。然后一直下一步安装即可。找到中国镜像，下载快。进入镜像后，点击这里。
贝叶斯统计模型java代码_贝叶斯地理统计模型R-INLA-1
weixin_42109598的博客
02-26 875
贝叶斯地理统计模型INLA本次博客主要讲述如何使用R-INLA软件进行空间分析，通过随机嵌套偏微分方程方法和集成的嵌套Laplace渐进法可为潜在高斯随机场模型中的边际分布提供准确而有效的估计。近年来已经广泛应用于空间流行病学领域。由于笔者水平有限，关于理论部分，可前往link，针对数学公式及理论部分，这里不赘述，简化数学公式，强调如何应用，及在R语言里面如何实现。安装INLA包INLA官网The...
【嵌入式拉普拉斯近似】Integrated Nested Laplace Approximation
wxl173的博客
06-18 1627
在贝叶斯范式中，模型中的所有未知量都被视为随机变量，其目的是计算（或估计）联合后验分布。这就是参数θ的分布，以观测数据y为条件。Pθ∣xPx∣θ⋅Pθ∫θPx∣θ⋅PθdθPθ∣x∫θ​Px∣θ⋅PθdθPx∣θ⋅Pθ​等式左边项Pθ∣XPθ∣X表示后验概率，其中Pθ∣X∝Pθ⋅PX∣θPθ∣X∝Pθ⋅PX∣θPx∣θPx∣θ表示似然。
R-INLA Project目录
weixin_52576658的博客
02-24 975
R-INLA
R语言-包的安装、载入及使用方法
DrugOne
01-01 5万+
一、原理简述 包是R函数、数据、预编译代码以一种定义完善的格式组成的集合。计算机上存储包的目录称为库（library）。函数.libPaths()能够显示库所在的位置，函数library()则可以显示库中有哪些包。 R自带了一系列默认包（包括base、datasets、utils、grDevices、graphics、stats以及methods），它们提供了种类繁多的默认函数和数据集。其...
R语言贝叶斯INLA空间自相关、混合效应、季节空间模型、SPDE、时空分析野生动物数据可视化...
最新发布
拓端研究室TRL
03-27 970
全文链接：https://tecdat.cn/?p=35518在统计建模过程中，经常会遇到空间自相关性的问题。空间自相关性是指相近位置的观测值往往比远离位置的观测值更相似。在尝试估计参数或进行预测时，空间自相关性可能会导致结果产生偏差（点击文末“阅读原文”获取完整代码数据）。相关视频INLA（Integrated Nested Laplace Approximation，集成嵌套拉普拉斯近似）是一...
【R语言】4种R包安装方式
热门推荐
小哲的博客
12-14 16万+
4种R包安装方式 第一种方式，当然是R自带的函数直接安装包了，这个是最简单的，而且不需要考虑各种包之间的依赖关系。 对普通的R包，直接install.packages()即可，一般下载不了都是包的名字打错了，或者是R的版本不够，如果下载了安装不了，一般是依赖包没弄好，或者你的电脑缺少一些库文件，如果实在是找不到或者下载慢，一般就用repos=来切换一些镜像。 > in...
基于INLA算法的贝叶斯推断及应用
毕业作品网站
11-16 1903
第五章进行实证分析，对实证所用的数据进行 Logistic 回归模型建模，并分别基于 MCMC 方法和 INLA 方法进行参数的贝叶斯估计，得到参数的后验均值、标准差和各分位数估计，以及近似的后验分布。第二章介绍预备知识，包括贝叶斯方法的内容与发展、Logistic 回归模型以及在实证分析中所使用的数据集。首先介绍拉普拉斯近似，其次介绍 INLA 方法适用的模型：隐高斯模型，并介绍高斯马尔科夫随机场，最后总结 INLA 方法，基于前面内容提出处理参数后验的新计算方式，使用一系列近似与数值积分得到参数后验。
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