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药研猿
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意大利团队新发现:基于元动力学模拟的gEDES方法显著提升虚拟筛选准确性,助力药物靶点研究
计算成本较高,模拟时间较长;目前仅在少数蛋白质上进行了验证,其普适性还需进一步在更多不同类型的蛋白质上进行测试;依赖于准确的结合位点预测,若结合位点预测不准确,可能影响最终结果。为极具挑战性的药物靶点生成结合态类似构象提供了通用框架,可应用于虚拟筛选、预测氨基酸突变对结构和动力学的影响以及蛋白质工程等领域;能准确区分活性和非活性化合物的结合模式和亲和力,对药物设计具有重要意义,有助于发现更多有潜力的先导化合物,或为已上市药物开拓新用途。原创 2025-02-13 13:29:48 · 665 阅读 · 0 评论 -
Gromacs-plumed元动力学
gromacs联用plumed实现运动力学采样原创 2023-07-30 20:15:19 · 1460 阅读 · 0 评论