【技术追踪】SynPo：基于高质量负提示提升无训练少样本医学图像分割性能（MICCAI-2025）

  SAM 新用法，无需训练，利用高质量负提示提升分割性能~

论文：SynPo: Boosting Training-Free Few-Shot Medical Segmentation via High-Quality Negative Prompts
代码：https://liu-yufei.github.io/synpo-project-page/

0、摘要

  大型视觉模型（Large Vision Models，LVMs）为小样本医学图像分割带来了新机遇。然而，现有基于 LVMs 的无训练方法未能有效利用负提示，在低对比度医学图像上表现不佳。（研究背景）

  为此，本文提出 SynPo，一种基于 LVMs（如 SAM）的无训练小样本分割方法，核心思想是提升负提示的质量。

  本文设计了置信图协同模块，融合 DINOv2 与 SAM 的优势，生成更可靠的置信图。基于该置信图，选取前 k 个像素作为正提示点集，并基于高斯分布选取负提示点集，随后分别对两者进行 K-means 聚类。最终，这些高质量提示点被输入 SAM 进行分割。大量实验表明，SynPo 的性能可与当前最优的有训练小样本方法相媲美。

1、引言

1.1、研究意义与当前挑战

  （1）利用 SAM 进行无训练小样本分割的流程可概括如 图 1(1) 所示。该方法以支持-查询图像对及支持掩膜为输入，首先通过强预训练视觉编码器（如 DINO）提取支持-查询图像对的特征图，随后利用余弦距离计算查询特征与目标特征之间的二维置信图，并将置信图中的最大值作为点提示，引导 SAM 在查询图像上完成交互式分割；

  （2）置信图的利用仍有改进余地： DINOv2 作为该范式中常用的特征提取器，在语义特征提取方面表现出色，但其采用相对位置编码，削弱了对绝对空间位置的感知，可能导致正提示点选择错误，如 图 1(2) 左下 所示，这会影响解剖先验的利用，进而导致分割结果在解剖结构上不一致；而同样广泛使用的 SAM-ViT 采用绝对位置编码，具备更强的空间定位能力，能够有效避免该问题，如 图 1(2) 右上 绿框所示；

  （3）负提示的选择策略较为粗糙： 导致分割性能下降。现有方法将置信图中与目标区域相似度最低的像素作为负提示，使得大多数负提示集中在背景区域，而非解剖区域内，图 1(3) 中的先导实验表明，该方式违背直觉，效果不佳；
  
Figure 1 | 无训练少样本分割面临的挑战：(1) 无训练小样本点提示分割模型的通用流程；(2) 不同置信图（C. Map）与真实标签对比，DINOv2 特征生成的置信图误将右侧无关区域识别为“相似”；SAM-ViT 特征的置信图数值区分度较低，本文提出的协同置信图融合两者优势，弥补各自不足；(3) 先导实验：在解剖区域外设置负提示，即使正提示位置相同，分割性能仍低于在区域内设置负提示；

1.2、本文贡献

  （1）提出了一种新颖的无训练方法 SynPo，包含置信图协同模块与点提示选择模块；

  （2）借助 SAM 在低层空间信息捕捉方面的优势，弥补 DINOv2 特征的不足，设计了置信图协同模块，该模块融合 DINOv2 的高层语义特征与 SAM-ViT 的绝对空间信息，提升解剖结构的识别能力并优化分割边界；

  （3）点提示策略模块通过在解剖区域内启发式地选择负提示，提升了负提示的信息量，增强了提示引导效果，减少了冗余信息；

  （4）引入噪声感知优化模块，结合标准形态学操作与 SAM 对粗分割结果进行细化；

2、方法

2.1、总览

  SynPo方法，如 图 2 (1) 所示，由三个核心部分组成：置信图协同模块（CMSM）、点选择模块（PSM）和噪声感知优化模块（NRM）。给定一个支持-查询对，首先使用预训练的视觉模型（SAM-ViT 和 DINOv2）提取零样本视觉特征。

  在 CMSM 中，特征图与支持掩码 ${\mathcal{M}}_S\in {\mathbb{R}}^{H\times W}$ 共同用于计算协同映射 $SynMap\in {\mathbb{R}}^{H\times W}$，并建模负置信度分布 $P_{neg}$，这些要素共同支撑提示信息的生成。

  在 PSM 中，协同映射中的像素按其置信度得分排序形成一个分级列表，该列表与置信度分布共同构成点提示选择的关键决定因素。

  最后，生成的点提示和查询图像 $I_Q$ 被输入到 SAM 中，以预测粗略掩码 ${\mathcal{M}}_{coarse}\in {\mathbb{R}}^{H\times W}$，此外，设计了额外的 NRM 来对 ${\mathcal{M}}_{coarse}$ 进行细化。

  
Figure 2 | ：（1）SynPo 架构概述；（2）置信图协同作用示意图；（3）点选择模块图示；

2.2、置信图协同模块（CMSM）

  如 图 2 (2) 所示，CMSM 是一种创新方法，它包含两个分支来生成协同图，并附带生成负置信度分布。对于上分支，使用 ${\mathcal{M}}_s$ 从 ${\mathcal{F}}_s$ 中提取与视觉概念中前景像素对应的支持特征：

  其中 ${\mathcal{T}}_S^i\in {\mathbb{R}}^{1\times c}$ ，$◦$ 表示空间维度乘法运算。随后，通过计算 ${\mathcal{T}}_S^i$ 与查询特征 ${\mathcal{F}}_Q$ 之间的余弦相似度，为每个前景像素 $i$ 生成 $n$ 个置信度图：

  接下来，采用平均池化方法来聚合所有 $n$ 个局部特征图，从而获得目标器官的整体置信度图 $\mathcal{S}\in {\mathbb{R}}^{H\times W}$。

  在生成负置信度图的下分支中，通过 ${\bar{\mathcal{M}}}_s$ 从 ${\mathcal{F}}_s$ 中裁剪出视觉概念内背景像素的支持特征，其中 ${\bar{\mathcal{M}}}_s$ 表示 ${\mathcal{M}}_s$ 的逆矩阵：

  其中 ${\mathcal{B}}_S^i\in {\mathbb{R}}^{1\times c}$ ，$◦$ 表示空间维度乘法运算。随后，将 ${\mathcal{B}}_S$ 视为 ${\mathcal{F}}_q$，并以相同方式计算负置信度图 ${\mathcal{S}}_{neg}$。

  随后，将 ${\mathcal{S}}_{SAM}$ 与 ${\mathcal{S}}_{DINO}$ 结合生成 $SynMap$：

  其中 $\odot$ 表示哈达玛积，且 ${\delta }_{S-D}+{\delta }_S+{\delta }_D=1$。第一项捕捉了两个矩阵之间的非线性相互作用，有效地放大了结果矩阵中的极端值。这增强了对两个置信度图中显著偏差的敏感性，同时降低了中性或中等数值的影响。此外，后续项为每个矩阵的贡献提供了受控权重。接下来，对 ${\mathcal{S}}_{neg}^{SAM}$ 和 ${\mathcal{S}}_{neg}^{DINO}$ 应用相同流程，生成融合表征，随后将其展平以获得 $SynMa{p}_{neg}\in {\mathbb{R}}^{(H\times W-1)\times 1}$：

  对于 $SynMa{p}_{neg}$，采用高斯概率密度函数对其中的每个像素值 $p_i$ 进行建模：

  其中 $\mu$ 和 $\sigma$ 通过最大似然估计得出。

2.3、点选择模块（PSM）

  将协同图中的每个像素点 $p_i=(x_i,y_i,c_i)$ 按照该像素置信度分数 $c_i$ 进行降序排列，其中 $x_i$、$y_i$ 表示该像素的坐标位置。

  对于正样本点，选取概率值 $p_i$ 的前 ${\gamma }_1\cdot K_p$ 个点，其中 ${\gamma }_1$ 是聚类比例因子，$K_p$ 代表期望的正样本点数量。所选点的坐标集合可表示为：

  其中 $p_i\in {\mathbb{R}}^2$。接下来，对这些坐标进行 K 均值聚类并选取 $K_p$ 个中心点，从而得到 ${\mathcal{P}}_{pos}$：

  其中 ${\mathcal{P}}_{pos}\in {\mathbb{R}}^{K_p\times 2}$代表坐标集合。

  对于负样本点，最多从置信区域选取 ${\gamma }_2\cdot K_n$ 个与感兴趣区域更相关的像素点，其定义如下列方程所示：

  其中 $\mu$ 和 $\sigma$ 源自 $SynMa{p}_{neg}$，$\alpha$ 和 $\beta$ 是用户定义的用于控制置信区间边界的常数。随后随机选取 ${\gamma }_2\cdot K_n$ 个像素点：

  随后，将类似的聚类方法应用于正样本点，得到 ${\mathcal{P}}_{neg}$：

  最终，取两个集合的交集并为这些点分配标签，从而得到该集合：

  其被输入至 SAM 模型以生成粗分割结果 ${\mathcal{M}}_{coarse}$。

2.4、噪声感知优化模块（NRM）

  该模块首先通过初始腐蚀操作来优化由 PSM 生成的原始粗糙掩膜 ${\mathcal{M}}_{coarse}$，以去除细小噪声，随后进行膨胀步骤以恢复主要结构区域。设 ${\mathcal{M}}_j$ 表示针对 ${\mathcal{M}}_{coarse}$ 第 $j$ 个连通区域 $C_j$ 所获得的掩膜，通过 ${\mathcal{M}}_j$ 对查询特征进行分割：

  其中 $|Cj|$ 表示 $C_j$ 区域内的总像素数。随后，将 $T_{Q,Cj}$ 视作 $F_q$，并采用相同方式计算 $C_j$ 区域的置信度得分，得到 ${\mathcal{S}}_{C_j}$。接着在每个连通域内计算均值：

  选择得分最高的连通区域作为 ${\mathcal{M}}_{refine}$，并将其作为掩码提示输入 PSM 模型。结合点提示，这有助于进一步细化分割结果。随后再次通过相同步骤处理输出，最终生成分割结果 ${\mathcal{M}}_{final}$。

3、实验与结果

3.1、实验设置

  （1）数据集与评价指标：Synapse-CT 数据集：30 例腹部 CT 三维扫描；CHAOSMRI 数据集：20 例 T2-SPIR 磁共振三维扫描；五折交叉验证报告 Dice 系数的标准差；

  （2）实施细节：将图像转换为 256×256 大小的感兴趣区域，使用 DINOv2 模型（Sinder）提取特征，得到一个空间尺寸为 64×64 的特征图。接着应用 SAM 模型（Sam2.1 Hiera 大图预测）获取相同空间尺寸 64×64 的特征图，分别对应高度和宽度。所有实验都在 NVIDIA RTX-3090 上进行。至于超参数，对于 Synapse-CT 和CHAOS-MRI，${\delta }_{S-D}$、${\delta }_S$ 和 ${\delta }_D$ 均设定为 0.8、0.1 和 0.1；

3.2、与最先进方法的比较

  
Table 1 | 与最先进方法的比较：除 PerSAM 和 SynPo 外，数据均来自其原始论文；

  
Figure 3 | 不同方法的质量结果：

3.3、消融实验

  
Table 2 | 消融模块研究：
Table 3 | CHAOS 任务中负提示策略的消融研究：

  
Figure 4 | 参数 $\alpha$ 与 $\beta$ 的实验，$\beta =\alpha -1.5$：

  prompt 也很值得研究呀( •̀ ω •́ )✧