Drugbank下载DDI数据集

DrugBank是一个需要注册的数据库,用户必须创建账户才能下载数据。免费账户和付费账户可能有不同的权限,免费的可能只能获取部分数据,而完整数据集需要订阅。

一、注册与登录

  1. 访问DrugBank官网(https://go.drugbank.com
  2. 点击"Sign Up"创建免费账户(学术用户可申请全量数据权限)
  3. 完成邮箱验证后登录账户

二、数据下载入口

  1. 在导航栏选择"Downloads"-"DrugBank Data"
  2. 选择"DrugBank Open Data"(免费版含基础DDI信息)或"DrugBank Premium"(订阅版含完整DDI数据)
  3. 同意最终用户许可协议(EULA)

三、数据文件说明

  • 核心DDI数据文件:drugbank_all_drugbank_ddi.csv
  • 字段包含: $$Drug1_ID, Drug1_Name, Drug2_ID, Drug2_Name, Interaction_Type, Description$$
  • 完整数据集包含48,584个药物对相互作用记录

四、数据处理建议

  1. 使用Python的pandas库解析CSV:
    import pandas as pd
    ddi_data = pd.read_csv("drugbank_all_drugbank_ddi.csv")
    print(ddi_data[ddi_data['Interaction_Type'] == 'contraindication'])
    
  2. 建议结合SIDER、OFFSIDES等数据库补充副作用数据
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值