dbCAN碳水化合物酶基因数据库及run_dbCAN4工具安装配置及使用_dbcan数据库本地构建(3)

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dbCAN（碳水化合物酶基因数据库）是一个专门用于在基因组中预测碳水化合物酶基因的在线工具。它基于隐马尔可夫模型（HMM）和BLAST搜索，能够在蛋白质序列中识别和注释不同类型的碳水化合物酶基因，包括纤维素酶、木质素酶、半纤维素酶、淀粉酶、果糖酶等等。 dbCAN是一个非常有用的生物信息学工具，对于研究纤维素生物转化、生物能源、生产生物基化学品等领域的研究具有重要意义。

Run_dbCAN是一个用于预测生物信息学中的碳水化合物活性酶的工具。它用于分析基因组或转录组数据，以识别编码碳水化合物活性酶的基因。

相关文章：

dbCAN2: a meta server for automated carbohydrate-active enzyme annotation | Nucleic Acids Research | Oxford Academic

dbCAN3: automated carbohydrate-active enzyme and substrate annotation | Nucleic Acids Research | Oxford Academic

dbCAN-seq: a database of carbohydrate-active enzyme (CAZyme) sequence and annotation | Nucleic Acids Research | Oxford Academic sequence and annotation | Nucleic Acids Research | Oxford Academic")

github最新版代码源

GitHub - linnabrown/run_dbcan: Run_dbcan V4, using genomes/metagenomes/proteomes of any assembled organisms (prokaryotes, fungi, plants, animals, viruses) to search for CAZymes. to search for CAZymes.")

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