GNN-CS224W:13 Community Structure in Networks

这一章没完全看完

connection between edge strength and edge structure

edge strength

在social network中可以用两个人之间联系的频率来得到，联系的频率越高，则strength越大，否则越小

edge structure

表示这个edge是处于一个cluster内部，还是处于不同cluster之间

edge overlap

用edge overlap来表示edge structure

Oij=∣(N(i)∩N(j))−{i,j}∣∣(N(i)∪N(j))−{i,j}∣O_{ij}=\frac{| (N(i) \cap N(j)) - \{ i, j \} |}{| (N(i) \cup N(j)) - \{ i, j \} |}Oij​=∣(N(i)∪N(j))−{i,j}∣∣(N(i)∩N(j))−{i,j}∣​

$N(i)$表示node i 的 neighbor 集合，分母表示两个node所有的neighbor，分子表示两个node的共同neighbor，所以$O_{ij}$表示node i 和 node j 的所有neighbor中共同neighbor的比例，

$O_{ij}$为0到1的值

$O_{ij}$越大，共同neighbor越多，这个edge更可能处在一个network的cluster里

$O_{ij}=0$时，the edge is a local bridge

connection

1. stronger edge strength 和 $O_{ij}$ 大 共同发生
   同一个cluster内部的人之间的联系次数更多
2. weaker edge strength 和 $O_{ij}$ 小 共同发生
   不同cluster之间的人联系次数相对更少

examples

1. 信息流动更多是通过weak edge来进行的
   因为一个cluster内部的信息同质化非常严重，所以cluster之间的交流会交换不同的信息，找工作的信息更多的是从熟人而不是亲密朋友之间得到的
2. 如下图为一个mobile call graph，点表示一个手机号，边表示不同手机号之间的联系次数，联系频繁的(红色)边都处于cluster内部，联系少的(黄色)边处于cluster之间
   

community detection

Community指的是network里的cluster，例如social network里联系紧密的小团体

Modularity $Q$

用来衡量已经被分开的groups of nodes 是否被切分的合理，可以作为community detection的优化目标。

$$Q\propto \sum _{s\in S}[(\#edgeswithingroups)-(expected\#edgeswithingroups)]$$

$S$为被切分的各个集合

$(\#edgeswithingroups)$表示实际的集合$s$里的edge数量

$(expected\#edgeswithingroups)$表示类似的random graph里的edge数量的期望

$(\#edgeswithingroups)-(expected\#edgeswithingroups)$ 表示实际的edge数量比期望的edge数量多多少，如果大于0，则比期望的多，则community内部联系比较紧密；如果小于0，则比期望的少，则community内部联系不太紧密

Modularity $Q$ 整体上衡量的是各个小community内部是否联系很紧密

Configuration Model

就是之前的subgrpah mining里的生成random graph方法

生成random graph时是整个graph一起生成，计算Modularity时是按局部community来计算

给定了graph里要包括$m$条边，$m$条边对应了$2m$个edge的endpoint，每个node的degree是给定的，degree代表了node作为endpoint的次数。

生成edge的方法为：每次从$2m$个endpoint中随机挑选两个，建立一条edge

edge可以从一个node出发并指向自己；两个node之间也可以有多条edge

the expected num of edge between node i and node j is

$$k_i\cdot \frac{k_j}{2m}=\frac{k_i{k}_j}{2m}$$

$k_i$、$k_j$为node i and node j 的degree，$m$为总的node数量

node i的degree为$k_i$，表示要随机挑选$k_i$个 endpoint 和 node $i$ 构成edge，

总endpoint数量为$2m$，node j 作为endpoint的次数为$k_j$，则每次挑选到node j 的概率为$\frac{k_j}{2m}$。

node i 要挑选$k_i$次，则node i and node j 之间edge数量的期望为$\frac{k_i{k}_j}{2m}$。

Configuration Model里不存在真实的random的graph，而是用node之间边的期望来代表这个graph的平均情况

Modularity $Q$

$$Q(G,S)=\frac{1}{2m}\sum _{s\in S}\sum _{i\in S}\sum _{j\in S}(A_{ij}-\frac{k_i{k}_j}{2m})$$

$G$为给定graph，$S$为给定的node partition， $A_{ij}$为adjacency matrix 中的值

$A_{ij}$为实际的node i 和node j 之间的边的数量，$\frac{k_i{k}_j}{2m}$为期望边的数量

在给定的graph的各个node community中，node之间的edge数量相比期望越大，则$Q(G,S)$越大，否则越小

衡量的是各个小的node community中的紧密程度

$Q$的取值范围为$[-1,1]$，这是因为有$\frac{1}{2m}$做了normalize

$Q$ greater than 0.3-0.7 means significant community structure

如果graph的edge有权重，Modularity也可以修改成对应的版本，修改方法为$A_{ij}$改成边的权重，$2m$改成graph里所有edge的权重的和

Louvain Algorithm

一种复杂度为$O(n\log n)$的community detection 算法，n为node num

特性

1. Provides hierarchical communities
2. Fast
3. Rapid convergence
4. High modularity output

Widely utilized to study large networks

phase 1

only allow local changes to node-communities memberships

先把每个node初始化为独立的community，依次遍历各个node，每个node执行以下操作：

1. 比较node的每个neighbor，计算如果node添加到neighbor所在的community 的Modularity Delta

   问题： 依次遍历node时，每个node都必须添加到一个community里吗？

2. 把node添加到Modularity Delta最大的那个neighbor所在的community
   这里的Modularity Delta必须是正的，即把node移动到另一个community后Modularity要增加

一遍又一遍的遍历所有node，直到移动任何一个node都不能再增加Modularity

遍历的对象始终是node，有可能node是一个独立的community然后合并到了另一个community，也有可能从一个community中移除然后添加到了另一个community

这是一种贪心算法

遍历node的顺序不同，最后形成的community也会不同

但是不同的顺序对整体的Modularity影响不大

Modularity Gain

node i 从community D移动到community C时的Modularity Gain：
$$\Delta Q(D\to i\to C)=\Delta Q(D\to i)+\Delta Q(i\to C)$$

前后两种partition的Modularity 中只有community D和C是不同的，所以只要计算这两个community的Modularity即可

$\Delta Q(D\to i)$为原来包括$i$的community和后来没有$i$的community的Modularity的差

$\Delta Q(i\to C)$为原来不包括$i$的community和后来包括$i$的community的Modularity的差

$$\begin{gathered} Q(C)=\frac{1}{2m}\sum _{i,j\in C}[A_{ij}-\frac{k_i{k}_j}{2m}] \\ =\frac{{\sum }_{i,j\in C}{A}_{ij}}{2m}-\frac{({\sum }_{i\in C}{k}_i)({\sum }_{j\in C}{k}_j)}{(2m{)}^2} \\ =\frac{{\sum }_{in}}{2m}-(\frac{{\sum }_{tot}}{2m}{)}^2 \end{gathered}$$

${\sum }_{in}$${\sum }_{tot}$

问题：算一个具体node时为什么要算community所有node的所有edge

问题

1. phase 1 时只有node被考虑吗？如果已经没有node了会怎么样？如果neighbor已经属于community了，那当前node是要添加到那个community里吗？
2. i添加到C里为什么要让C中每个node的边都加进来？
3. 计算community C时的m是什么？是其中所有node的degree的和还是其中所有edge的数量？
4. phase 1以后会把所有community抽象成一个node来处理吗？