本文详细介绍了如何使用Linux的sort命令进行多字段排序，特别是针对基因数据的实例。通过设置参数-k和-n，可以先按染色体排序，再按起始位点排序。示例中展示了sort命令的用法，如`sort -t '' -k1,1 -k2n,2 data`，以及等价的`sort +0-1 +1n-2`，最终得到了正确排序的结果。
本文研究的主要是linux sort多字段排序，具体介绍如下。
Linux多数发行版自带的sort程序，非常强大，在此只说多字段排序
sort 有个参数-k，可以指定字段，有比较复杂的语法，不在文本范围内。
一下为一段数据(从基因中得到，仅仅作为demo),文件名为 datachr13 3008566 3008677
chr9 3024384 3024515
chr19 3157071 3157172
chr5 3236386 3236476
chr13 3041044 3041191
chr12 3045343 3045532
chr6 3087308 3087625
chr5 3109870 3110091
chr9 3115454 3115531
字段中间以空格分开
现在想首先按照染色体进行排序，然后相同的染色体上的基因按起始位点进行排序，那么这就是一个多字段的排序，而且第二个字段为数字，使用sort命令如下
sort -t ' ' -k1,1 -k2n,2 data
其中 -t ' ' 指定使用空格分列-k1,1 指定以第一列为关键字排序
-k2n,2 指定以第二列为关键字做数据排序
也可以使用
sort +0 -1 +1n -2
效果是一样的。
排序结果chr12 3045343 3045532
chr13 3008566 3008677
chr13 3041044 3041191
chr19 3157071 3157172
chr5 3109870 3110091
chr5 3236386 3236476
chr6 3087308 3087625
chr9 3024384 3024515
chr9 3115454 3115531
总结
以上就是本文关于linux sort多字段排序实例解析的全部内容，希望对大家有所帮助。感兴趣的朋友可以继续参阅本站其他相关专题，如有不足之处，欢迎留言指出。感谢朋友们对本站的支持！
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