生物分子仿真软件： Desmond_（6）.分子动力学模拟参数设置

最新推荐文章于 2025-08-23 09:43:10 发布
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分子动力学模拟参数设置

在生物分子仿真软件中，分子动力学模拟（MD）是一个核心功能，用于研究生物分子在不同条件下的行为和动态过程。正确的参数设置对于获得准确和可靠的模拟结果至关重要。本节将详细介绍如何在Desmond中设置分子动力学模拟的参数，包括常见的参数选项、参数的选择依据以及如何通过编程接口进行参数设置。

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1. 模拟类型选择

1.1 NVT和NPT模拟

在分子动力学模拟中，常用的两种模拟类型是NVT（恒定粒子数、体积和温度）和NPT（恒定粒子数、压力和温度）。选择合适的模拟类型取决于研究的具体目标和环境条件。

  • NVT模拟：在NVT模拟

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