MR|孟德尔随机化常用的GWAS数据库

当我们明确了研究假设、制定完孟德尔随机化（MR）分析计划后，就要开始进行数据分析。众所周知，MR分析依赖于GWAS数据，GWAS数据包括两种：（1）单个队列的GWAS结果；（2）多个队列GWAS的meta分析。因此，今天将简单介绍几个常用的GWAS数据的数据库。

GWAS Catalog数据库：https://www.ebi.ac.uk/gwas/

GWAS Catalog（全称：Genome-Wide Association Study Catalog）是一个存储基因组范围关联研究（GWAS）结果的数据库。收集、整理和提供了各种研究中发现的基因-表型关联数据。其是EMBL-EBI旗下的一个数据库，收录了比较全的公开发表的GWAS分析结果。

该数据库提供了以下信息：关联的基因和基因变异、关联疾病或表型特征、关联研究的文献引用和出版物关联的遗传变异的基因组位置、关联效应大小和统计学显著性。

常用的有以下3个模块：

1. Search

可以根据以下多种条件进行检索

发表论文

遗传位点

表型，性状

基因

染色体上某个区域

2. Diagram：以疾病为单位进行检索，查看每种疾病所有相关SNP位点的结果，结果展示了所有关联的SNP位点在染色体上的分布

3. 下载：下载关联分析的结果，提供了多种格式的结果供下载