BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是NCBI（美国国家生物技术信息中心）提供的一个基本的局部序列比对搜索工具，用于在数据库中查找序列，尤其是寻找序列之间的相似性。BLAST可以用来查询基因序列、蛋白质序列等信息。该工具由Lushan Wang于2010年11月24日介绍，它在生物信息学时代的重要性可与分子生物学时代的PCR技术相媲美。BLAST的功能强大，查询速度快，能够在几分钟内完成对目标基因的序列搜索和分析，而传统的方法可能需要几周的时间。BLAST的工作原理主要是将用户输入的序列与数据库中的序列进行快速比对，以找出它们之间的相似性。BLAST的网页版可以通过www.ncbi.nlm.nih.gov进入。用户只需在网页上“Enter sequences here”处输入自己的序列数据，即可开始搜索。BLAST还提供了多种查询方式，包括以生物学信息为主检索数据的Entrez系统和以序列为主检索相关信息的BLAST。Entrez系统可以提供包括基因组、蛋白质序列、结构数据等在内的多种数据类型。BLAST的使用方法是生物信息学研究中的一项基本技能，科研人员通过使用BLAST，可以快速地对未知序列进行同源性搜索和功能预测。
BLAST的运行原理主要是基于这样一个假设：相似的序列往往具有相似的生物学功能和进化关系。因此，通过比对序列之间的相似性，可以推断出序列的功能和进化关系。BLAST的核心算法包括快速搜索、动态规划等，能够高效处理大数据量的序列比对任务。BLAST分为多种类型，包括但不限于BLASTp（蛋白质数据库）、BLASTn（核苷酸数据库）、BLASTx（蛋白质序列比对核苷酸序列）、tBLASTn（核苷酸序列比对蛋白质序列）等，以满足不同类型的搜索需求。BLAST在现代生物信息学研究中有着广泛的应用，包括基因组注释、系统发育分析、基因表达分析、疾病基因的鉴定等。
随着计算机技术的发展，生物信息学数据分析的速度越来越快，计算能力越来越强。BLAST就是这类先进工具中的代表，它能够在计算机的帮助下，读取人类难以解读的复杂数据，并将结果以简洁明了的方式呈现给研究人员。这极大地加快了生物信息学领域的研究进程，使研究人员能够快速得到他们需要的数据，加速了新发现的产生。因此，掌握BLAST的使用方法，对从事生命科学、医学、农学等领域的研究人员来说是必不可少的技能。
由于生物信息学是一个不断发展的领域，BLAST也在不断地更新和改进中。了解和掌握最新的BLAST使用方法，对于科研人员来说是十分重要的。在使用BLAST的过程中，研究人员需要知道如何正确地输入查询序列，如何选择适合的参数设置，以及如何解读BLAST输出的比对结果。BLAST的输出结果通常包括序列的匹配区域、相似度评分、期望值（E值）等关键信息，这些信息是评估查询序列与数据库中已知序列相似程度的重要指标。通过对这些结果的深入分析，研究人员可以确定待研究序列的功能、进化关系，甚至可以发现新的功能基因或疾病相关基因。BLAST是生物信息学研究中不可或缺的工具，它极大地提高了研究的效率和质量，推动了生命科学领域的快速发展。
