在讨论如何解决Windows Server 2008 R2安装.NET Framework 4时遇到的灾难性故障问题之前，我们首先需要了解.NET Framework的相关知识以及Windows Server 2008 R2的基本操作。.NET Framework是微软公司开发的一套用于构建和运行各种应用程序的软件框架，它提供了大量的预构建功能，从而简化了开发过程。Windows Server 2008 R2是微软发布的一个服务器操作系统版本，它在2008版本的基础上进行了改进和优化。
灾难性故障通常是指系统运行中遇到了严重错误导致无法继续执行操作，这种情况下，系统往往会弹出相应的错误代码或者错误信息。在安装.NET Framework 4的过程中，如果遇到灾难性故障，错误提示可能是“8000FFFF”，这意味着安装过程中存在某些关键的权限或者依赖项问题。
根据给定文件，遇到安装.NET Framework 4时出现灾难性故障的主要原因是Windows Server 2008 R2的安全设置方案取消了C盘根目录的Users组权限，仅保留给administrator和system账户。由于.NET Framework安装过程中需要更新系统文件，如果Users组没有相应的权限，更新操作就会失败。
解决这个问题的一个方法是为C盘根目录添加Users组的读取和运行权限。这样可以确保在安装.NET Framework 4的过程中，非管理员账户也能拥有足够的权限来完成必要的操作。然而，出于安全考虑，在.NET Framework补丁更新完成后，应该重新取消Users组的权限，以避免可能的安全风险。
此外，如果在使用Windows Update安装.NET Framework 4后仍然遇到“8000FFFF”错误，可能需要执行一系列额外的步骤来清除.NET安装信息并重新安装补丁。具体步骤如下：
1. 运行services.msc或者在计算机上点击右键选择管理，找到Windows Update服务，停止运行该服务；
2. 删除C:\Windows\SoftwareDistribution目录，这个目录是Windows Update用来缓存下载文件的，清除它可以帮助解决一些更新问题；
3. 重新启动第一步中停止的Windows Update服务；
4. 重新安装.NET Framework 4。
有时候，问题的根源在于.NET Framework 3.5 SP1的安装。即便目标是安装.NET Framework 4，仍可能需要.NET Framework 3.5 SP1的相关补丁包。如果安装过程中遇到问题，可以使用dotnetfx_cleanup_tool工具来清除.NET相关的安装信息和缓存，然后再进行重新安装。dotnetfx_cleanup_tool是一个官方提供的工具，用于清理.NET Framework的安装文件，以解决安装过程中可能出现的错误或冲突。
请注意，在进行上述操作时，需要确保你有足够的权限来更改系统设置和文件权限，并且在进行任何更改之前最好备份重要数据，以防出现意外情况导致数据丢失。如果问题依然无法解决，可能需要进一步的系统日志分析或者寻求专业技术人员的帮助。
