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matlab视网膜图像分割代码-Matlab-codes-for-FM-image-analysis:用于鼠标整体FM图像分析的...

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2021-06-12
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matlab一种图像分割代码Matlab-codes-for-FM-image-analysis 这是一系列用于分析小鼠全视网膜色素上皮 (RPE) 平贴图像的 Matlab 代码。 该研究的目的是将整个 RPE 平面图像分割成单个细胞并进行各种形态测量分析。 应使用 Photoshop(Adobe Photoshop CS2;Adobe, San Jose, CA)手动修剪整个 RPE 平面安装图像(示例图像可在 中找到)。 通过基于机器学习的方法(例如,ImageJ 插件“Trainable Weka Segmentation”、“ilastik”等)将图像二值化为单元格边框和背景。 然后这些代码可以连续应用于二值化图像。 代码 #1 - 制作骨架图像并删除错切的单元格 代码 #2 - 用于手动选择单元格的图形用户界面(由 Matlab 应用程序设计人员制作) 代码 #3 - 根据距视盘中心的距离对单个细胞进行形态测量分析。 结果导出为 Excel 文件。 代码 #4 - 准备主成分分析 (PCA)。 所有的图像数据都被组合成一个单一的数组。 代码 #5 - PCA 和绘图。 PC
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