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内容概要:本文介绍了针对生物信息学专业的Linux操作系统与Shell编程课程的教学大纲。课程总计48学时,分为理论教学(32学时)和实验教学(16学时)。主要内容涵盖Linux的历史与发展,系统管理、文件与目录操作、进程管理和Vim编辑器,还有深入探讨了Shell编程及脚本撰写技巧。教学过程中重视实践和创新思考能力的培养,采用了混合式教学方式并设有明确的思想政治目标来加强职业素质建设。 适用人群:主要是面向高校生物信息学本科生,旨在帮助他们打好未来专业软件使用和技术研究的基础。 使用场景及目标:本大纲适用于开设此门课程的大专院校,在教授学生掌握Linux基本原理及其编程的同时提升他们解决问题的实际技能,支持生物信息学领域的长远发展。 其他说明:大纲制定了严格的评价标准,包括考勤表现、课堂参与度以及实验成绩,并最终通过上机考试确定学生的掌握情况。同时提供了一些优质的教材和在线资源推荐,以便于师生更好地准备和支持课程学习。
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《Linux 操作系统与 shell 编程》教学大纲
一、课程简介
课程名称:Linux 操作系统与 shell 编程
代码:0213130002
属性:理论课/实验课
性质:必修课
类型:专业基础课
学时:总 48 学时,其中理论 32 学时、实验 16 学时
适合专业:生物信息学专业
考核方式:考查
开课学期:第三学期
课程性质、目的和任务:Linux 是一个功能强大、性能全面的多用户、多任
务操作系统,可以应用从巨型计算机到普通 PC 机等多种不同的平台上,是应用
面最广、影响力最大的操作系统。Linux 操作系统是伴随着信息技术发展而不断
发展的一门学科。它的理论发展和应用水平直接反映了一个国家高新技术的发展
水平,并是其现代化程度和综合国力的重要标志。在以信息化带动工业化和工业
化促进信息化的进程中,Linux 操作系作为计算机应用的载体扮演了越来越重要
的角色,广泛应用于国家机关、外事机构、企事业单位环境中,基本的操作系统
知识,已经成为工作生活的常识。shell 是操作系统的最外层。shell 合并编程语
言以控制进程和文件,以及启动和控制其它程序。通过本课程的学习,使学生进
一步了解及掌握计算机操作系统的基本原理及实现方法,掌握 Linux 操作系统的
使用及开发,灵活使用 shell 控制语句进行编程,为今后生物信息学软件的使用
打好基础。
二、主要教学改革
混合式教学等。

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4
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三、教学方法
在教学中坚持理论联系实际,运用课堂讲授、实验、互动讨论等多种方法,
充分调动教与学两个方面积极性,切实提高教学效果。
1
、课堂讲授:以学生为中心,强调发挥学生的主体学习作用。在理论教学
环节中引入具有科学意义的案例,落实课程思政环节,采用多媒体教学,使图像、
动画、视频等得到充分的展示,增强学生的理解;
2
、实验:教师结合案例系统讲解、示教,将提问、讨论和学生亲自操作、
练习相结合,培养学生动手能力,使学生加深理解、验证巩固课堂教学内容,增
强对
Linux
操作系统的认识,掌握
shell
的编程能力,培养学生理论与实践相结
合的能力;
3
、互动讨论:通过启发式教学,促使学生积极思考,调动学生的积极性,
增强其创新思考的能力。
四、考核方式
(一)过程性考核(30%):考勤 10% + 课堂交流 10% + 实验 10%。过程性考
核低于 60 分者,不得参加终结性考核。
(二)终结性考核(70%):采用上机考试。终结性考核的上机成绩如低于 60
分,课程总成绩计不及格。
(三)成绩构成:过程性考核 30%+终结性考核 70%。
五、教学目标要求
(一)思想道德与职业素质要求(课程思政目标)
根据教育部关于印发《高等学校课程思政建设指导纲要》的通知(教高〔2020〕
3 号)文件精神描述。
1、培养学生严谨的工作作风以及创新性思维模式和实践能力。 (支撑生物
信息学专业本科教育计划思想道德与职业素质目标第 2 条。)
2、培养学生终身学习的观念。(支撑生物信息学专业本科教育计划思想道德
与职业素质目标第 3 条。)

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5
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3、培养学生有效的利用已有知识积累,创造新的知识成果,促进教育、科
学事业的发展。(支撑生物信息学专业本科教育计划思想道德与职业素质目标第
3 条。)
(二)知识结构要求
1、掌握系统和扎实的生物医学软件工程和生物大数据的理论知识。(支撑生
物信息学专业本科教育计划知识目标第 1 条)
2、了解国内外生物医学信息和大数据技术发展动态,能够适应生物信息学、
生物医学科技发展与高新技术产业发展的新需要。(支撑生物信息学专业本科教
育计划知识目标第 2 条)
3、掌握 Linux 操作系统的使用及开发
4、掌握 shell 语句的使用,灵活使用 shell 控制语句进行编程。
(三)能力结构要求
Linux 操作系统与 shell 编程要求学生了解及掌握计算机操作系统的基本原
理及实现方法,掌握 Linux 操作系统的使用及开发,灵活使用 shell 语句进行编
程。从而具备系统的生物医药领域数据分析处理、软件开发和平台建设能力,具
备应用生物医学软件工程技术分析、解决生物医学实际问题的能力。同时介绍当
前领域内的新成就,让学生了解 Linux 操作系统的新动态。(支撑生物信息学专
业本科教育计划技能目标第 2 条)
六、学时分配
本大纲供生物信息学专业教学使用。总课时 48 学时,其中课堂讲授 32 学时,
实验 16 学时。
Linux 操作系统与 shell 编程理论教学时数安排
内容
理论
实验
PBL
/CBL
指导性
自学
其它
合计
合计
32
16
48
Linux 操作系统概述
2
1
3
Linux 的安装登录与退出,浏览文件
系统
2
1
3
文件、目录列表命令
2
1
3
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