La aplicación muestral de Saber 5° evaluará a una muestra representativa de estudiantes a nivel nacional, mientras que la aplicación censal evaluará a todos los estudiantes de 5° grado del país. El ICFES coordinará los aspectos logísticos de la aplicación muestral, mientras que los rectores serán responsables de la aplicación censal siguiendo los procedimientos establecidos. Antes de las pruebas, los estudiantes recibirán información sobre los objetivos, estructura y cuestionarios a responder.