La película cuenta la historia de Rizvan Khan, un hombre musulmán con síndrome de Asperger que vive en Estados Unidos. Se enamora y casa con una mujer hindú llamada Mandira, pero después del 11 de septiembre su matrimonio enfrenta discriminación. Cuando el hijo de Mandira es asesinado en un ataque racista, ella culpa a Rizvan y lo echa. Él decide encontrar al presidente de EE.UU. para decirle que su nombre es Khan y que no es terrorista, recorriendo el país. Finalmente logra su objetivo