【nnUNetv2进阶】十二、nnUNetv2 魔改网络-小试牛刀-引入SPPF

<think>好的，用户想了解如何在远程服务器上使用nnUNet v2的教程。首先，我需要确认用户是否具备基本的环境配置知识，比如Python环境和Docker的使用。nnUNet是一个医学图像分割工具，版本升级到v2后可能有些变化，需要查阅官方文档确认步骤。 用户提到是远程服务器，可能需要指导如何连接到服务器，安装必要的依赖，比如CUDA和cuDNN，以及配置数据集的路径。可能还需要解释如何上传数据到服务器，处理数据格式，运行训练和推理命令。 另外，用户可能没有提到但需要注意的问题包括权限问题、存储空间、GPU资源管理，以及可能遇到的常见错误，比如环境变量设置不正确或者数据集结构不对。需要提醒用户按照nnUNet的要求组织数据集，确保文件结构正确。 是否需要比较nnUNet v2和旧版的区别？可能用户是从旧版迁移过来的，所以简要说明变化会更好。还要考虑用户是否有使用经验，如果是新手，可能需要更详细的步骤，比如安装步骤、环境配置的具体命令。 最后，生成相关问题时，应该涵盖安装配置、数据准备、实际应用、常见问题等方面，帮助用户全面了解使用过程中可能遇到的各个环节。</think>以下是在远程服务器上使用nnUNet v2的详细教程： ### 一、环境配置 1. 连接远程服务器： ```bash ssh username@server_ip -p port_number ``` 2. 安装miniconda： ```bash wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh bash Miniconda3-latest-Linux-x86_6.sh ``` 3. 创建虚拟环境： ```bash conda create -n nnunetv2 python=3.9 conda activate nnunetv2 ``` 4. 安装依赖： ```bash pip install torch==2.0.1 torchvision==0.15.2 --extra-index-url https://download.pytorch.org/whl/cu118 pip install nnunetv2 ``` ### 二、数据准备 1. 按照nnUNet规范组织数据： ``` Dataset001_ABC/ ├── dataset.json └── imagesTr/ ├── case_0000_0000.nii.gz └── ... ``` 2. 设置环境变量： ```bash export nnUNet_raw="/path/to/nnUNet_raw" export nnUNet_preprocessed="/path/to/preprocessed" export nnUNet_results="/path/to/results" ``` ### 三、训练流程 ```bash # 数据预处理 nnUNetv2_plan_and_preprocess -d 001 --verify_dataset_integrity # 训练2D模型 nnUNetv2_train 001 2d all # 训练3D全分辨率模型 nnUNetv2_train 001 3d_fullres all ``` ### 四、推理预测 ```bash nnUNetv2_predict -i input_dir -o output_dir -d 001 -c 3d_fullres ``` [^1]