加拿大生信开源学习资源Bioinformatics.ca

之前给大家推荐过教育部首批490门“国家精品在线开放课程”,里面很多跟生物或编程相关的免费经典课程。除了国内这些开放的学习资源外,还有许多国外的免费资源,比如英语写作常见错误和视频中是斯坦福大学老师的授课视频,很经典。如果时间紧张,只看前两节也挺好。

今天给大家推荐的是 加拿大安大略癌症研究所(Ontario Institute for Cancer Research) 推出的各种生信课程。该机构每年都会举办数场生物信息学研讨会(CBW),并共享其课件与视频,每一份都是沉甸甸的财富,真业内良心!!!

大家可以复制链接:https://bioinformatics.ca/ 进入官网查看。

img

2018年共开展了11门研讨会,如下:

1. Bioinformatics for Cancer Genomics

2. Introduction to R

3. Exploratory Analysis of Biological Data using R

4. Informatics on High Throughput Sequencing Data

5. Informatics for RNA-seq Analysis

6. Analysis of Metagenomic Data

7. Informatics and Statistics for Metabolomics

8. Bioinformatics of Genomic Medicine

9. Epigenomic Data Analysis

10. Pathway and Network Analysis of Omics Data

11. Infectious Disease Genomic Epidemiology

img

所有资料在Past Workshops处可获取,所有讲解视频可在Youtube上在线观看,课程资料共享于Github,均可下载(pdf或PPT格式)。除了可下载的资料,每门课程介绍中还有很多超链接,点击即可跳转至相关的学习资料,内容十分丰富。

不喜欢听英语的朋友,可以使用youtube视频里设置——字幕——英语(自动生成)功能,生成字幕阅读,识别还是相当快速准确的!

img

img

img
img

为了方便大家学习,除了关于R的两门课程均为在线文档,没有可供下载的课件,生信宝典将其他9门课程的教程都下载下来了,打包分享给大家!

添加小编微信即可获取

img

分析中,`t.test` 函数在R语言中用于执行独立样本的t检验,主要用于比较两个样本平均值是否有显著差异。其基本语法如下: ```r t.test(x, y = NULL, alternative = "two.sided", mu = 0, var.equal = FALSE, paired = FALSE, conf.level = 0.95, ..., trim = 0, na.rm = TRUE, exact = FALSE) ``` 参数说明: - `x` 或 `y`: 要比较的数值向量,如果只有一个变量,则视为单样本;如果有两个,则进行双样本比较。 - `alternative`: 检验假设,默认为"two.sided",即两侧检验(两尾),还有"greater"(单侧,上侧)和"less"(单侧,下侧)。 - `mu`: 默认为0,表示零假设,即两组平均值相等。 - `var.equal` (布尔): 如果设为`TRUE`,则假定两组数据方差相等,否则会计算分母更复杂的Welch's t检验。 - `paired` (布尔): 是否为配对样本检验,默认为`FALSE`。 - `conf.level`: 显著性水平,默认为95%,即置度。 - `trim` (数字): 对两端指定比例的数据进行截断,避免异常值影响结果。 - `na.rm` (布尔): 是否删除缺失值,默认删除。 - `exact` (布尔): 对于小样本,是否进行精确p值计算,默认为`FALSE`,使用连续近似。 使用这个函数时,通常需要先准备好要对比的两个变量,然后根据研究目的选择适当的参数设置。例如,比较两组学分数的均值差异可以这样操作: ```r # 假设有两个样本数据,分别存储在 vectors x 和 y 中 scores_x <- c(85, 92, 78, 90) scores_y <- c(88, 86, 90, 94) # 进行t检验 t_test_results <- t.test(scores_x, scores_y) summary(t_test_results) # 查看结果摘要 ```
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

生信宝典

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值