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原创 生信宝典:生物信息学习系列教程、视频、资源

欢迎关注天下博客:http://blog.genesino.com/2100/01/shengxinbaodian/生信的作用越来越大,想学的人越来越多,不管是为了以后发展,还是为了解决眼下的问题。但生信学习不是一朝一夕就可以完成的事情,也许你可以很短时间学会一个交互式软件的操作,却不能看完程序教学视频后就直接写程序。也许你可以跟着一个测序分析流程完成操作,但不懂得背后的原理,不知道什么参数需...

2018-01-31 10:02:40 10801 3

转载 Sebastian Raschka长文:DeepSeek-R1、o3背后,RL推理训练正悄悄突破上限

也就是说,优势计算涉及另外两个模型,这些模型的规模通常与我们正在微调的原始模型相同。他们采用了基础版本的概率策略优化算法(vanilla PPO),而非 DeepSeek-R1-Zero 中所使用的广义随机策略优化算法(GRPO),并省略了强化学习对人类反馈(RLHF)流程中常见的 Kullback-Leibler 正则化项(KL regularization)。有趣的是,论文还发现,这些长链模型在短推理方面的表现也出人意料地好,在相同的 token 长度下,甚至超过了 GPT-4o 等更大的模型。

2025-09-02 21:02:54 7

转载 iMeta期刊 第4卷第4期 在线正式发布

目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!在未来农业中,合成菌群应用延伸至太空、深海、极地场景,为未来农业系统注入更大自主性,彰显技术突破环境限制的变革力,推动“Environment-Free Farming”迈向可持续未来。

2025-09-02 21:02:54 6

转载 Advanced Dialogues | 开学季特别篇:与两位科学家的对话(傅静远,Henry Daniell)

例如,口腔癌是由HPV和厌氧菌(具核梭杆菌、牙龈卟啉单胞菌)引起的,因此,人们需要了解不同的基因组。因此,如果不了解口腔中病毒、细菌和酵母菌的基因组以及宿主细胞的反应,就无法治疗口腔癌。就我个人而言,身兼大型期刊主编、审阅数千篇稿件、写基金支持大量研究人员、创办生物技术公司、处理100多项专利、FDA审批文件、教学和出差,这些工作不可能在每周40小时内完成。因此,我的生活和工作是深度融合、不可分割的。最重要的是,我喜欢旅行,这让我找到平衡和灵感。根据我的职业生涯,我提供的一个重要指导是寻找。

2025-09-01 21:00:54 20

转载 The Innovation Life | 人工智能与生命科学前沿综述

平台如TAIR、FlowerMate 2.0和CyVerse等通过高效的数据处理和分析,促进了植物学研究的快速发展,特别是在实验室成果转化为实际应用的过程中,AI的自动化和模块化设计加速了这一进程。然而,植物学中的大数据仍面临挑战,尤其是数据存储、整合、标准化以及复杂性分析等问题,植物组学数据的快速增长提供了关键的研究信息,但如何高效管理和分析这些海量数据,仍需不断优化技术和算法。未来,随着数据库的不断完善和AI技术的广泛应用,这些问题得到解决的同时,也势必会进一步推动动物学相关领域的发展。

2025-09-01 21:00:54 37

转载 GPB | DRED: 一个因重复序列扩增而导致疾病的基因数据库

目前已知的通过STRs扩增而导致的疾病有64种,但这些疾病的致病STRs序列及其致病的拷贝数阈值等信息均分散于不同报道中,尚缺乏统一的STRs致病基因数据库。但目前尚未建立专门收录STRs扩增相关致病基因的数据库。中收集和整理所有STRs扩增相关疾病及其致病基因,并收集这些基因的注释、扩增的STRs、STRs致病扩增频次、人群变异情况等多种信息,汇编成一个可供用户迅速检索的数据库。预测得到的潜在STRs扩增致病基因与已知的STRs扩增致病基因具有相似的STRs组成特征和致病预测评分(研究员为该文通讯作者。

2025-08-31 21:00:37 32

转载 2025年新规!国自然要求20%论文发在国产期刊,国际项目更高达50%

目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!资助(集中接收期间)面上项目、青年项目(A、B、C类)、地区项目、重点项目、创新研究群体项目、重点国际(地区)合作研究项目、外国学者研究基金项目和合作创新研究团队项目等10类项目共。

2025-08-30 21:02:05 75

转载 iMeta大会2025第三天: 生物技术专场/生物医药/博后论坛/科研培训/研究生论坛

目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!下午在会场一是科研培训专场和研究生论坛(一),会场二是研究生论坛(二),在两个会场由。” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!

2025-08-28 21:03:00 84

转载 中科院分子植物创新中心王勇团队发现裸子植物双黄酮合成关键酶CYP90Js,助力神经退行性疾病药物开发

这一发现不仅揭示了植物体内双黄酮合成的分子基础,填补了长期存在的知识空白,更是首次在植物中发现能够高效、位点特异性构建分子间碳-碳键的P450酶。在应用方面,团队利用合成生物学策略,将 GbCYP90J6 等关键基因导入工程化大肠杆菌,成功重建了穗花杉双黄酮的生物合成通路,实现了从头合成,产量达到 4.75 mg/L,显著高于植物提取效率(0.059 mg/g DW),为双黄酮的低成本、规模化生产提供了新方案。,系统揭示了其催化双黄酮合成的分子机制与进化起源,并在微生物中实现关键双黄酮分子的从头合成。

2025-08-27 21:01:03 145

转载 iMeta大会2025第二天: 开幕式/特邀报告/人才进阶论坛/植物前沿论坛/微生物论坛

参加本次大会的的嘉宾分别有邓子新院士、谢明勇院士、李培武院士、金梅林院士、印遇龙院士和朱依谆院士等来自各高校和研究所的国家级人才70余位,以及在场的各位老师和同学500余人。开幕式之后,由上海交通大学邓子新院士、南昌大学谢明勇院士、中国农科院油料所李培武院士、山东大学刘双江教授、澳门科技大学朱依谆院士、承葛医药集团徐炜总监、系列期刊进展报告和未来规划的报告,然后颁发了执行副主编、青年编委聘书,随后各位编委踊跃发言讨论,对。下午会议分三个会场进行,会场一举办了人才进阶论坛,由。会场二举办了微生物论坛,由。

2025-08-27 21:01:03 60

转载 iMeta大会2025第一天:医学(基础/肿瘤/菌群)/人才成长论坛/医学论坛/生物(微生物/生信)/中医药高峰论坛

目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2025年6月影响因子33.2,中科院分区生物学1区Top,位列全球SCI期刊前千分之三(65/22249),微生物学科2/163,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆5/585!” 子刊,专注于医学、健康和生物技术领域,目标是成为影响因子大于15的医学综合类期刊,欢迎投稿!分钟的精彩报告,覆盖生命、医学和交叉学科的方方面面,近。以下为人才成长论坛简图(以下为部分报告人)

2025-08-26 21:03:18 44

转载 Science | 上海交大李健/海军军医大学张卫东教授:人工金合欢醇内烯烃环氧化酶:从酶工程到萜类天然产物的高效合成

结合 TMS-促进的级联环化策略,作者显著简化了多醚及多环萜类天然产物的合成路线,最长线性步骤平均减少 50–70%,展示了“酶催化 + 创新化学”整合策略在复杂天然产物合成中的强大潜力。酶-底物复合物模型:通过分子对接和突变实验推测,EPO6 催化口袋的突变位点(特别是 M177C、A330N、V78C)协同重塑了底物结合构象,使 C6–C7 双键精准对准高价铁-氧活性中心,从而实现高区域及对映选择性。• Oikawa 路线中的双环氧片段 9 原需 21 步,现降至 4 步,总收率 51%。

2025-08-25 21:01:49 63

转载 生命科学部和农学学部2025年两院院士有效候选人名单

经中国工程院第八届主席团第十六次会议审议,中国工程院党组审定,确认中国工程院2025年院士增选有效候选人660人。根据《中国工程院院士增选工作实施办法》的规定,现将有效候选人名单予以公布。经中国科学院学部主席团审议,中国科学院党组审定,确认2025年中国科学院院士增选有效候选人639人。根据《中国科学院院士增选工作实施办法(试行)》的规定,现将有效候选人名单予以公布。关于公布2025年中国科学院院士增选有效候选人名单的公告。关于公布中国工程院2025年院士增选有效候选人名单的公告。

2025-08-24 21:01:32 1933

转载 iMeta | 中科院微生物所刘宏伟组-嗜黏蛋白阿克曼菌低酰基化脂多糖通过激活 TLR4−IL-23−IL-22 通路对抗肥胖

点击蓝字 关注我们嗜黏蛋白阿克曼菌来源的低酰基化粗糙型脂多糖通过激活 TLR4−IL-23−IL-22免疫轴缓解饮食诱导的肥胖iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 原文: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70066● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70066● 2025年7月17日,中国科学院微生物研

2025-08-23 21:01:57 404

转载 Plant Journal | 广中医王宏斌/靳红磊团队揭示温度调控穿心莲二萜内酯类活性成分生物合成的分子机制

为了探究温度对穿心莲发育和药效成分的影响,将穿心莲培养在22℃、25℃、28℃,结果发现,在22℃、25℃、28℃生长45d到90d的穿心莲,从生物量到穿心莲内酯含量上都随着温度的上调而上调(图1a,b)。此外,为了探究温度在短期内对穿心莲内酯的影响,将在25℃生长45d的穿心莲分别转移到22℃和28℃培养,结果发现,在转移到28℃培养5d开始,穿心莲内酯的积累量就出现了显著性上调的差异(图1c,d),这说明,暖温28℃可以在短期和长期中显著性促进穿心莲内酯的积累。最全1000+植物核基因组数据库IMP。

2025-08-23 21:01:57 88

转载 2025 年10月 | 家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析实战

为满足广大读者进一步学习的需求,易生信课程开发团队 (现运营《生信宝典》和《聊生信》两个公众号)经长期规划,筹备和专家研讨,现组织和开展临床基因组学专题培训课程,以便进一步普及和交流临床基因组学分析技术,手把手带您快速入门,节约宝贵的时间,助力科研成果早日产出。使用R语言等统计与可视化工具,绘制常用生信相关图形,包括:热图 (变异水平),maftools图 (基因水平),基因的结构、变异位置及结构域标记 (棒棒糖图),基因组Circos图,IGV基因组浏览器,PPI网络图,基因功能的富集结果图。

2025-08-23 21:01:57 56

转载 Cell | 王佳伟研究组开发基因挖掘新策略 突破植物发育生物学研究瓶颈

在模式植物拟南芥中,该流程得出了细胞图谱与基于参考基因组的结果(WRG流程)在图谱拓扑结构(A),每个cluster的标记基因(B和C),细胞类群和cluster相似性(D和E)上都具有很高的一致性。综上,这些研究成果不仅在植物单细胞转录数据分析技术和资源(图谱)方面取得了显著进展,而且揭示了全新的生物学现象并挖掘出新的发育基因,为最终建立植物泛细胞图谱(Plant Cell Atlas),实现植物发育生物学复兴奠定了坚实的基础。高颜值免费 SCI 在线绘图。点击图片直达文字对应教程。

2025-08-22 21:03:14 189

转载 iMetaOmics | 中国农业科学院质标所陈爱亮组-打造益生菌检测新范式

点击蓝字 关注我们开发基于微流控芯片与图像识别的便携式益生菌活力检测系统,助力现场检测与质量控制iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊:iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70045● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70045● 2025年8月3日,中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所孙小云、

2025-08-21 21:03:16 127

转载 Nat. Methods | 全基因组尺度的细胞形态学扰动图谱

该研究利用大规模 ORF 过表达与 CRISPR 敲除手段,结合 Cell Painting 多通道成像技术,系统绘制了覆盖超过1.5万个基因的形态学图谱,并通过机器学习与知识图谱整合验证了其在揭示基因功能网络与新型生物学关系中的强大潜力,突破性地展示了单细胞形态学在功能基因组学与药物发现中的应用前景。实际上,细胞的形态特征往往是其内在分子状态的直观映射,而这些微观形态的系统性解析,可能为我们揭示基因的功能网络与潜在作用机制提供独特的窗口。图中给出与对照差异最大的实例,直观呈现核、骨架、线粒体、内质网与。

2025-08-21 21:03:16 71

转载 iMetaOmics | 基因组所李伟组-早期苦参碱干预肠道菌群预防二型糖尿病

点击蓝字 关注我们早期苦参碱干预肠道菌群可以预防二型糖尿病iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊: iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70046● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70046● 2025年8月5日,中国农业科学院深圳基因组所李伟老师团队在iMetaOmics在线发表了题为“Early

2025-08-20 21:01:04 187

转载 Innovation(IF 25.7)| 屠呦呦/王继刚团队揭示青蒿琥酯在疟疾感染小鼠中对CD8+GZMB+ T细胞免疫调节作用

正如UMAP所展示的那样,我们根据典型标志物对 11 种主要细胞类型进行了标注:红细胞(Hba-a1+)、肝细胞(Alb+)、内皮细胞(Endo,Kdr+)、T/NK 细胞(Cd3e+Nkg7+)、B 淋巴细胞(B 细胞,Cd79a+)、浆细胞(Plasma,Igkc+)、血小板(Pf4+)、单核细胞或巨噬细胞(Mono/Macro,Cd68+)、中性粒细胞(S100a9+)、树突状细胞(DC,Irf8+)和肥大细胞(Cpa3+)(图 1B)。感染期间,淋巴结中的抗原加工和呈递途径得到了增强的激活。

2025-08-19 21:00:42 393

转载 更新 | RStudio-Server安装要点

4. 将R装在/usr/local/bin/之下。对于后期RStudio-Server调用R非常重要!涉及Linux服务器的SELinux和iptables,以及花生壳上的映射。成功编译、安装了R程序后才能安装RStudio-Server。注意8787设置为内网IP的端口,而不是映射后外网的端口。RStudio-Server调用此R的绝对路径。Linux服务器,CentOS8,根用户。R和RStudio-Server使用最新版。1. 安装R和RStudio-Serve。访问RStudio-Server。

2025-08-19 21:00:42 70

转载 iMeta | 中山大学陈保卫组-解析极地土壤中抗生素新型抗性基因

点击蓝字 关注我们功能宏基因组学揭示极地土壤中新的抗生素抗性组iMeta主页:http://www.imeta.science研究论文● 期刊: iMeta (IF 33.2, 中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70069● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70069● 2025年8月3日,中山大学谢秀琴、陈保卫、栾天罡和暨南大学附属广东省第二人民医院程伟彬等在iMeta在

2025-08-17 21:01:11 151

转载 多位杰青上榜!2025年北京学者拟入选名单公示

为便于核实、反馈有关情况,提倡反映人提供真实姓名、联系方式或工作单位。我们将严格遵守工作纪律,履行保密义务。公示期间,若对公示对象有异议,任何单位和个人均可通过来电、来信、来访等方式向北京市人才工作局反映。联系地址:北京市通州区运河东大街56号院北京市人才工作局专家工作处(邮编:100743)经人选推荐、评审,共产生29名北京学者计划拟入选人选,现对名单进行公示。若有侵权,请联系我们,我们将及时修改或删除!公示时间:2025年7月25日至7月31日。高颜值免费 SCI 在线绘图。点击图片直达文字对应教程。

2025-08-16 21:02:30 86

转载 2025年度中华中医药学会科学技术奖·华佗中医药奖评审结果公示

任何单位和个人对公示的结果有实质异议或有文字错漏需要更正的,请以真实身份书面形式向中华中医药学会科技评审部提出,否则不予受理。根据《中华中医药学会科学技术奖奖励章程》中有关规定,现将评审结果予以公示,公示期为。华佗中医药奖评审工作日前结束,评选出拟授奖团队。最全1000+植物核基因组数据库IMP。通讯地址:北京市朝阳区樱花园东街甲。年度中华中医药学会科学技术奖。年度中华中医药学会科学技术奖。年度中华中医药学会科学技术奖。高颜值免费 SCI 在线绘图。点击图片直达文字对应教程。华佗中医药奖评审结果。

2025-08-16 21:02:30 84

转载 iMetaOmics | 中科院深圳先进院戴磊组综述:皮肤微生物组工程

粪菌移植(FMT)已被广泛用于肠道微生物相关疾病的治疗,类似地,皮肤微生物组移植(SMT)通过将健康皮肤微生物群移植到患者的皮肤上,以恢复皮肤微生态平衡并改善疾病状态。我们讨论了非靶向方法,如益生菌和菌群移植,这些方法旨在重塑微生物群落,以及更具针对性的策略,如噬菌体疗法、噬菌体裂解酶和工程化细菌,这些方法可特异性调控微生物群落或改变皮肤环境。尽管对于许多皮肤疾病而言,皮肤微生物组的变化究竟是病因还是疾病的结果仍不明确,但大量研究已经证实,特定皮肤微生物与某些皮肤疾病之间存在紧密联系(图 2)。

2025-08-15 21:02:15 356

转载 刘天罡/刘然/张帆团队NC┃构建用于高效合成Ⅱ型聚酮天然产物的通用底盘

型聚酮,是红色染料胭脂红酸的重要中间体。虽然以链霉菌为宿主时能够规避研究产物类型单一的限制,但仍需辅助代谢工程手段,如增加合成前体和还原力供应、敲除负调控基因、过表达正调控基因等方式,这意味着人力和时间的额外支出。此外,研究团队推测模式工业底盘相较于模式底盘可能存在其他天然优势,比如核心单元(最小聚酮合酶)的基因转录与蛋白表达问题,这也是其他类型宿主,如真菌、酵母和大肠杆菌异源表达。基于理想底盘的特性,如良好的菌落表型(产孢、菌落分离度及表型稳定性)、适宜的发酵周期和简便的遗传操作流程等,

2025-08-14 21:01:42 68

转载 iMetaMed | 上海五院张静组-切片与词典:医疗大数据的新方法

本研究设计了一种多维度数据切片策略,以适应不同临床研究的需求,具体而言,该策略包括临床维度切片,即根据参数类型(如生命体征、实验室检查、用药情况等)对数据进行划分;切片与词典方法的核心优势在于:降低资源需求(通过按需加载切片,使普通计算设备能够处理大规模数据)、提高查询效率(精准定位所需数据,避免全表扫描,显著提升查询速度)、增强灵活性(支持多维度切片和可定制词典,以适应多样化的研究需求),以及跨数据库通用性(该方法设计不依赖于特定的数据库结构)。这种情况下,采用垂直切片(行切片/观测切片)更为适宜。

2025-08-14 21:01:42 62

转载 iMetaOmics | 港城大孙燕妮组-基于短读长的全感染组分类学分析流程

点击蓝字 关注我们RTTAP: 基于短读长的全感染组分类学解决方案赋能宏转录组数据分析iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/方法论文● 期刊:iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70044● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70044● 2025年7月29日,香港城市大学孙燕妮和武汉大学中南医院陈良君等在iMetaO

2025-08-13 12:03:53 151

转载 快讯:分子生药学发展30周年研讨会暨第十三届分子生药学暑期研讨会顺利召开

苏州市卫生健康委员会党组书记、主任章鸣林、中国中医科学院副院长舒静、研究生院副院长马晓北、教育管理处副处长毛超一、福建农林大学校长兰思仁、甘肃中医药大学副校长晋玲、西湖大学副校长许田、中国中西医结合学会分子生药学专业委员会主任委员、中国中医科学院医学实验中心副主任袁媛等出席开幕式。周年研讨会暨第十三届分子生药学暑期研讨会围绕中药道地性、中药生物技术、中药合成生物学、中医药数据科学、中药分子鉴定等方向,设置了。家高校、科研院所、医院及企业等单位的专家、学者和研究生代表共计。点击图片直达文字对应教程。

2025-08-11 21:00:54 98

转载 2025 年8月15-17 | 家系、肿瘤临床基因组/外显子组数据分析实战

为满足广大读者进一步学习的需求,易生信课程开发团队 (现运营《生信宝典》和《聊生信》两个公众号)经长期规划,筹备和专家研讨,现组织和开展临床基因组学专题培训课程,以便进一步普及和交流临床基因组学分析技术,手把手带您快速入门,节约宝贵的时间,助力科研成果早日产出。使用R语言等统计与可视化工具,绘制常用生信相关图形,包括:热图 (变异水平),maftools图 (基因水平),基因的结构、变异位置及结构域标记 (棒棒糖图),基因组Circos图,IGV基因组浏览器,PPI网络图,基因功能的富集结果图。

2025-08-11 21:00:54 96

转载 iMeta | 被引超10500次,发文319篇,平均引用32.95,百引耗时4天(2025/8/3)

根据 Dimensions 网站统计,截止2025年8月3日,iMeta 己发表论文319篇,被引10511,平均引用32.95,百引耗时4天。引超4200次,百引耗时14天;● iMeta | 被引超1400次,发文122篇,平均引用11.55,百引耗时18天(2023/10/5)● iMeta | 被引超2100次,发文151篇,平均引用13.96,百引耗时16天(2024/1/23)● iMeta | 被引超2800次,发文179篇,平均引用15.88,百引耗时16天(2024/4/17)

2025-08-10 21:02:16 85

转载 iMetaOmics | 中科院城环所叶国注组-解析微塑料暴露下肠道微生物富集特征及其功能紊乱

点击蓝字 关注我们聚苯乙烯微塑料暴露诱发肠道微生物富集条件下氧化还原稳态、神经和激素功能相关代谢紊乱特征iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/研究论文● 期刊:iMetaOmics● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70043● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70043● 2025年7月23日,中国科学院城市环境研究所叶国注、云谱康(

2025-08-10 21:02:16 234

转载 华中农大校长严建兵等入选!第十八届谈家桢生命科学奖候选名单揭晓

经由谈家桢生命科学奖奖励委员会委员、中国科协生命科学学会联合体主席团成员和谈家桢生命科学奖评审专家委员会委员组成的函评专家评审,经投票进入评审阶段的被推荐候选人包括:谈家桢生命科学成就奖6名、谈家桢生命科学国际合作奖3名、谈家桢临床医学奖7名、谈家桢生命科学产业化奖4名、谈家桢生命科学创新奖22名。,男,1972年3月出生,天津医科大学党委副书记、校长,天津医科大学肿瘤医院院长,教授、主任医师。,男,1963年10月出生,中国科学院院士,香港中文大学校长、教授,香港科学院院长。

2025-08-09 21:02:01 454

转载 iMeta | 尹佟明组和汪阳东组-开发用于细胞器基因组的高效图形化组装工具包PMAT2

点击蓝字 关注我们PMAT2:用于细胞器基因组的高效图形化组装工具包iMeta主页:http://www.imeta.science方法论文● 期刊: iMeta (IF 33.2,中科院双一区Top)● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imt2.70064● DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.70064● 2025年7月1日,南京林业大学尹佟明和中国林科院汪阳东等在iMeta在线发表了题为“PMAT2:

2025-08-08 21:02:53 96

转载 J Adv Res|中国医学科学院药用植物研究所孙晓波/罗云研究员团队:缺血性卒中内细胞来源的细胞外囊泡促进神经元内质网应激损伤

缺血性卒中具有高发病率、高死亡率、高致残率、高复发率等特点。近年来仅围绕单一细胞损伤的保护已不足以开发发病机理复杂的脑卒中创新药物,血管内皮细胞与神经元等细胞之间通讯成为研究热点。最后,基于神经元损伤保护策略,研究者从已上市神经保护药物中筛选并证实了丁苯肽能够靶向并抑制。在缺血性脑卒中发生与发展中扮演重要作用,但阐明其分子机制以及药物干预策略具有重要的意义。介导的神经元损伤分子机制,更揭示了其能够作为抗缺血性脑卒中新药研发新的治疗靶点的潜力。”的研究论文,主要介绍了大脑微血管内皮细胞来源的细胞外囊泡中。

2025-08-07 21:02:49 110

转载 iMetaOmics | 李英/赵江潮组-基于HiFi测序的宏基因组组装策略在MAG构建中接近单菌基因组的组装精度

点击蓝字 关注我们基于HiFi测序的宏基因组组装策略在MAG构建中接近单菌基因组的组装精度iMetaOmics主页:http://www.imeta.science/imetaomics/方法论文● 原文链接: https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/imo2.70041● DOI: https://doi.org/10.1002/imo2.70041● 2025年7月8日,佛山大学李英、邓飞龙和华南农业大学赵江潮等在iMetaOmics在线发表了题为“HiF

2025-08-06 21:02:22 89

转载 iMeta系列期刊青年编委招募 (IF 33.2中科院双一区)

目的是发表所有领域高影响力的研究、方法和综述,重点关注微生物组、生物信息、大数据和多组学等前沿交叉学科。2024年6月获得首个影响因子23.8,位列全球SCI期刊前千分之五(107/21848),微生物学科2/161,仅低于Nature Reviews,学科研究类期刊全球第一,中国大陆11/514!单篇第一或通讯作者论文IF > 10,且2篇或3篇累计IF > 20 (共同第一作者IF除以作者顺序,共同通讯作者顺序倒数)前沿交叉学科发展,期刊特色包括双语全文和视频、可重复分析、图片打磨、青年编委、

2025-08-06 21:02:22 87

转载 Adv Sci丨中科院冯桂海/周琪/王鹏飞/马英克等研究发现FemXpress可通过X连锁SNP解析单细胞X染色体失活异质性

至关重要的是,在每个器官的同一种细胞类型中,我们发现了一些由于失活X染色体的亲本来源差异而导致表达差异的基因。在每个器官中,我们识别出候选的XCI逃逸基因,并在每种细胞类型中观察到与XCI起源相关的基因表达差异,这些差异可能导致表型变异。在本研究中,我们展示了 FemXpress,这是一种用于研究雌性 scRNA-Seq 样本中 XCI 异质性的分析工具,它通过基于 X 染色体上表达基因的连锁单核苷酸多态性 (SNP) 对细胞进行聚类。高颜值免费 SCI 在线绘图。点击图片直达文字对应教程。

2025-08-04 21:02:49 142

转载 新课第五期,9月 | 单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源

代码,记录了分析的过程和细节,存档在计算机中,便于使用、回顾、审查、优化、发表和共享。世代周期短,进化/演化迅速。对于其它物种,如大型动/植物基因组 (尤其是跨物种),则不适用此课程,原因包括:实施难度 (动/植物基因组的组装难度更大),分析模块 (动/植物无需做传播与溯源分析)及中间数据 (本课程主要利用核心基因组构树,而非同源基因)等。本课程的技术与理论体系,也有助于微生物实验室/课题组:建立系统的基因组分析流程,完善质量管理体系,培养相关生信人才,提示软件、流程及数据库的开发方向和评估方法。

2025-08-03 21:01:57 72

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition

Survey of Text Mining: Clustering, Classification, and Retrieval, Second Edition I. Clustering, II. Document retrieval and representation, III. Email surveillance and filtering, and IV. Anomaly detection. 著名大师Michael W. Berry的经典力作!

2010-03-02

Masterminds of programming

  Description    Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. Think along with Adin D. Falkoff (APL), James Gosling (Java), Bjarne Stroustrup (C++), and others whose vision and hard work helped shape the computer industry. You'll find advice you can apply to systems you're developing, even if you don't use the specific languages being discussed.   Full Description   Masterminds of Programming features exclusive interviews with the creators of several historic and highly influential programming languages. In this unique collection, you'll learn about the processes that led to specific design decisions, including the goals they had in mind, the trade-offs they had to make, and how their experiences have left an impact on programming today. Masterminds of Programming includes individual interviews with:   * Adin D. Falkoff: APL   * Thomas E. Kurtz: BASIC   * Charles H. Moore: FORTH   * Robin Milner: ML   * Donald D. Chamberlin: SQL   * Alfred Aho, Peter Weinberger, and Brian Kernighan: AWK   * Charles Geschke and John Warnock: PostScript   * Bjarne Stroustrup: C++   * Bertrand Meyer: Eiffel   * Brad Cox and Tom Love: Objective-C   * Larry Wall: Perl   * Simon Peyton Jones, Paul Hudak, Philip Wadler, and John Hughes: Haskell   * Guido van Rossum: Python   * Luiz Henrique de Figueiredo and Roberto Ierusalimschy: Lua   * James Gosling: Java   * Grady Booch, Ivar Jacobson, and James Rumbaugh: UML   * Anders Hejlsberg: Delphi inventor and lead developer of C#   If you're interested in the people whose vision and hard work helped shape the computer industry, you'll find Masterminds of Programming fascinating.  

2010-12-26

gvim常用插件及其配置文件配置(下载解压即可使用)

gvim常用插件及其配置文件 支持c,perl,python,latex。 需要自己安装ctags .vim: after compiler doc indent ltags perl-support skeleton syntax autoload c-support ftdetect keymap Makefile plugin snipMate.vim.ct tools colors CVIMSYN ftplugin latextags Makefile.in README.csupport snippets .vim/after: ftplugin plugin syntax .vim/after/ftplugin: c_snippets.vim java_snippets.vim python_pydiction.vim python_snippets.vim sh_snippets.vim .vim/after/plugin: .vim/after/syntax: cpp.vim c.vim java.vim .vim/autoload: acp.vim perlsupportgui.vim perlsupportprofiling.vim perlsupportregex.vim snipMate.vim .vim/colors: desertEx.vim peachpuff.vim zenburn.vim .vim/compiler: tex.vim .vim/c-support: codesnippets doc rc scripts templates wordlists .vim/c-support/codesnippets: calloc_double_matrix.c main.cc print_array.cc.noindent calloc_int_matrix.c Makefile print_double_array.c.noindent main.c Makefile.multi-target.template print_int_array.c.noindent .vim/c-support/doc: ChangeLog c-hotkeys.pdf c-hotkeys.tex .vim/c-support/rc: customization.ctags customization.gvimrc customization.indent.pro customization.vimrc .vim/c-support/scripts: wrapper.sh .vim/c-support/templates: c.comments.template cpp.comments.template cpp.preprocessor.template c.statements.template c.cpp.template cpp.cpp.template cpp.statements.template Templates c.idioms.template cpp.idioms.template c.preprocessor.template Templates~ .vim/c-support/wordlists: c-c++-keywords.list c-c++-keywords.list.bak k+r.list stl_index.list .vim/CVIMSYN: engspchk.contraction engspchk.dialect engspchk.dict engspchk.match engspchk.proper engspchk.rare .vim/doc: acp.jax latexhelp.txt latex-suite-quickstart.css Makefile taglist.txt acp.txt latex-suite latex-suite-quickstart.html Makefile.in tags catalog.xml la

2010-08-17

Data Mining in Bioinformatics 生物信息中的数据挖掘

Jason T.L. Wang, Mohammed J. Zaki,Hannu T.T. Toivonen and Dennis Shasha (Eds) Summary The aim of this book is to introduce the reader to some of the best techniques for data mining in bioinformatics in the hope that the reader will build on them to make new discoveries on his or her own. The book contains twelve chapters in four parts, namely, overview, sequence and structure alignment, biological data mining, and biological data management.

2010-03-02

比perl好的生物信息学语言python

比perl好的生物信息学语言python,简明教程!

2009-09-26

空空如也

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