R中提取当前路径下所有同时含有“pseudo“、“deg“和“rds“字符串的文件的全路径

生信小博士

于 2024-03-02 00:25:40 发布

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文章标签： r语言 java 服务器

本文链接：https://blog.csdn.net/qq_52813185/article/details/136408531

该文章展示了如何在R编程中使用`list.files`函数递归查找文件，然后通过`grep`和`normalizePath`等函数筛选出同时包含特定字符串（如pseudo,deg,rds）的文件，并将相对路径转换为绝对路径。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >



# 递归地列出所有文件
files <- list.files(path = ".", pattern = NULL, all.files = FALSE, full.names = TRUE, recursive = TRUE)
files
# 过滤出同时包含"pseudo"、"deg"和"rds"的文件
target_files <- grep("pseudo.*deg.*rds|deg.*pseudo.*rds|pseudo.*rds.*deg|deg.*rds.*pseudo|rds.*pseudo.*deg|rds.*deg.*pseudo", files, value = TRUE, ignore.case = TRUE)
target_files

# 将相对路径转换为绝对路径
absolute_paths <- normalizePath(target_files) ;absolute_paths

basename(absolute_paths)


final_dirs= stringr::str_split(string = absolute_paths,pattern = "/",simplify = TRUE)[,6] ;final_dirs