学习生信的过程中怎么能少了Linux呢。但是很多人都是Linux新手,又不想花钱买服务器,这里有个免费的网页版Linux服务(链接在文末),足够学习基础的Linux命令!
如果是新手,就认真跟着教程走就行,看左半边的教程,学习,然后点击next进入下一步。
当你学习完之后,后续还有更多的教程哦!
在这里你可以学习很多Linux基础语法!
下面是一些基础而常见的Linux命令:
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ls
:列出目录中的文件和子目录。 -
cd
:改变当前目录。 -
pwd
:显示当前目录的路径。 -
mkdir
:创建新目录。 -
rmdir
:删除空目录。 -
touch
:创建空文件或者更新文件的时间戳。 -
cp
:复制文件或目录。 -
mv
:移动或重命名文件或目录。 -
rm
:删除文件或目录。 -
cat
:查看文件内容、创建文件、文件合并、追加文件内容等功能。 -
more
和less
:分页查看文件内容。 -
grep
:搜索文件内容。 -
find
:在目录树中查找文件。 -
chmod
:更改文件或目录的权限。 -
chown
:更改文件或目录的所有者和组。 -
ps
:查看当前运行的进程。 -
kill
:结束一个进程。 -
top
:动态显示进程状态。 -
df
:显示磁盘空间使用情况。 -
du
:显示目录或文件的磁盘使用情况。 -
wget
:从网络上自动下载文件。 -
curl
:向/从服务器传输数据。 -
ssh
:远程登录到其他计算机。 -
scp
:在本地和远程之间安全地复制文件。 -
echo
:在屏幕上显示一段文本。 -
tar
:压缩或解压文件。 -
gzip
/gunzip
:使用gzip压缩或解压文件。
另外几个高级命令
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grep
:这个命令用于搜索文本,并显示匹配指定模式的行。它非常强大,可以使用正则表达式来定义复杂的搜索条件。 -
awk
:这是一个非常强大的文本处理工具,主要用于数据提取和报告生成。awk
通过对数据行和字段的操作,以及使用内置的文本处理功能,可以执行复杂的数据分析任务。 -
cut
:这个命令用于按列切分文本数据。你可以指定分隔符,并提取文本中的特定字段。它通常用于从文本行中提取所需的列。 -
sed
:是流编辑器,用于对文本数据进行过滤和转换。sed
可以读取指定的文本,执行处理指令后输出结果。它经常用于自动编辑一个或多个文件;简化重复的文本操作;编写转换程序等。
这些命令各自有着广泛的用途和强大的功能,学会它们能大大提高在Linux环境下工作的效率。例如,你可以使用grep
来搜索含有特定文本的文件行,使用awk
来分析和生成报告,使用cut
来提取文本列,使用sed
进行复杂的文本替换和数据转换。
关于sandbox.bio
sandbox.bio是为生物信息学爱好者和研究者设计的一个在线学习和实践平台。它旨在提供一个易于接近、交互式的环境,用户可以在其中学习和实验生物信息学的基础知识和高级技术。这个平台的特点包括:
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WebAssembly技术: 使用WebAssembly技术使得传统的生物信息学工具能够在浏览器中运行,这意味着用户不需要在本地安装复杂的软件包和依赖项就可以开始学习和实验。
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交互式教程: 提供一系列从基础到高级的教程,这些教程涵盖了生物信息学的各个方面,包括但不限于基因序列分析、蛋白质结构预测、基因组注释等。通过交互式的示例和任务,用户可以边学边做,加深理解和掌握。
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沙盒环境: 所有的学习和实验都在一个安全的沙盒环境中进行,这意味着用户可以自由地实验各种命令和脚本,而不用担心影响到自己的计算机系统或数据。
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面向所有水平的用户: 无论是生物信息学的新手还是有经验的研究者,sandbox.bio都提供了丰富的资源和工具来满足不同用户的需求。
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社区支持: 用户可以通过平台与其他学习者和专家交流,分享知识和经验,解决学习过程中遇到的问题。
通过这些特点,sandbox.bio旨在降低生物信息学学习的门槛,让更多人能够接触并掌握这一跨学科领域的知识和技能。
生信小博士
【生物信息学】R语言开始,学习生信。Seurat,单细胞测序,空间转录组。 Python,scanpy,cell2location。资料分享
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参考
https://sandbox.bio/tutorials/terminal-basics
https://sandbox.bio/tutorials
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