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rmg安装教程

时间: 2025-05-30 17:06:44 浏览: 32

### RMG 安装指南 RMG（Reaction Mechanism Generator）是一款用于自动生成化学反应机理的工具。以下是详细的安装步骤： #### 1. 环境准备确保计算机满足以下条件： - Python 版本应为 3.x[^5]。 - 推荐使用虚拟环境来隔离依赖包，可以通过 `venv` 或 `conda` 创建虚拟环境。 ```bash # 使用 venv 创建虚拟环境 python3 -m venv rmg_env # 激活虚拟环境 source rmg_env/bin/activate ``` #### 2. 下载源码通过 Git 克隆 RMG 的官方仓库到本地机器上。 ```bash git clone https://github.com ReactionMechanismGenerator/RMG-Py.git cd RMG-Py ``` #### 3. 安装依赖库进入克隆下来的目录并执行安装命令。 ```bash pip install --upgrade pip setuptools wheel pip install -r requirements.txt ``` 某些情况下可能还需要额外配置 Cython 和其他编译器支持[^6]。 #### 4. 配置数据库 RMG 运行过程中会频繁调用其内置的反应数据库。首次启动前需初始化这些数据表。 ```bash python setup.py build_ext --inplace python scripts/database/buildDatabase.py ``` #### 5. 测试安装完成以上步骤后可以运行简单的测试案例验证安装是否成功。 ```bash pytest tests/ ``` 如果所有单元测试均顺利通过，则表明 RMG 已经正确部署完毕[^7]。 #### 注意事项对于远程服务器上的 RMG 实施，建议采用 SSH 密钥认证方式提升安全性，并参照相关资料将 OpenSSH 默认密钥格式转成 PPK 类型以便于跨平台兼容性处理[^8]。 ```bash ssh-keygen -t rsa -b 4096 -C "[email protected]" # 将生成的公钥添加至目标主机 authorized_keys 文件内 cat ~/.ssh/id_rsa.pub | ssh user@host 'mkdir -p ~/.ssh && cat >> ~/.ssh/authorized_keys' ```

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