活动介绍

include(FetchContent) include(ExternalProject) cmake_minimum_required(VERSION 3.16.0) project(SWMM5Plus VERSION 1.0.2) enable_language (Fortran) find_package (Python3 COMPONENTS Interpreter) set(testing_available ON) set(CPACK_SET_DESTDIR ON) function(check_python_dependencies module) message(STATUS "Looking for Python module '${module}'") execute_process(COMMAND pip show ${module} OUTPUT_QUIET ERROR_QUIET RESULT_VARIABLE EXIT_CODE_PIPSHOW ) if (NOT ${EXIT_CODE_PIPSHOW} EQUAL 0) set(testing_available OFF PARENT_SCOPE) message(WARNING "\nMissing Python module '${module}'\n**Testing unavailable**\nPlease run python_dependencies.sh\n") else() message(STATUS "'${module}' found") endif() endfunction() if (NOT (CMAKE_Fortran_COMPILER_ID STREQUAL "Intel" OR CMAKE_Fortran_COMPILER_ID STREQUAL "IntelLLVM")) message(FATAL_ERROR "Intel Fortran compiler not found. Found ${CMAKE_Fortran_COMPILER_ID} instead. This project supports Intel Fortran (ifort) and IntelLLVM (ifx).") else() message(STATUS "Detected Intel Fortran compiler: ${CMAKE_Fortran_COMPILER_ID}") endif() function(commentout IN_FILE line_num) file (STRINGS ${IN_FILE} LINES) file(WRITE ${IN_FILE} "") set(line_counter 1) foreach(LINE IN LISTS LINES) if (${line_counter} STREQUAL line_num) string(PREPEND LINE "//") endif() MATH(EXPR line_counter "${line_counter}+1") file(APPEND ${IN_FILE} "${LINE}\n") endforeach() endfunction() get_filename_component(build_configuration ${CMAKE_BINARY_DIR} NAME) if (build_configuration STREQUAL "build") set(default_build_type "Release") message(STATUS "Building inside '${build_configuration}' named folder, setting configuration as '${default_build_type}'") elseif (build_configuration STREQUAL "dwflow") set(default_build_type "Release") message(STATUS "Building inside '${build_configuration}' named folder, setting configuration as '${default_build_type}'") message(WARNING "Lines [249-252] will be commented out from 'interface/src/dwflow.c'") elseif(build_configuration STREQUAL "debug") set(default_build_type "Debug") message(STATUS "Building inside '${build_configuration}' named folder, setting configuration as '${default_build_type}'") set(CMAKE_Fortran_FLAGS "${CMAKE_Fortran_FLAGS} -g -traceback -debug extended") endif() set(CMAKE_C_FLAGS "${CMAKE_C_FLAGS} -fPIC -lm -lpthread -shared -fcommon") #set(CMAKE_Fortran_FLAGS "${CMAKE_Fortran_FLAGS} -coarray=distributed -ldl") set(CMAKE_Fortran_FLAGS "${CMAKE_Fortran_FLAGS} -coarray=shared -fPIC -traceback") set(FETCHCONTENT_QUIET OFF) set(BUILD_COARRAY_NUM_IMAGES 1 CACHE STRING "Set up the number of processors to use for parallel SWMM5+.") set(BUILD_HDF5 "C:/Users/Admin/gw20250625/SWMM5plus-v-1.0.2/build/_deps/hdf5-src") set(hdf5_SOURCE_DIR "C:/Users/Admin/gw20250625/SWMM5plus-v-1.0.2/build/_deps/hdf5-src") set(HDF5_INCLUDE_DIR "C:/Users/Admin/gw20250625/SWMM5plus-v-1.0.2/build/_deps/hdf5-src/include") set(HDF5_LIB_DIR "C:/Users/Admin/gw20250625/SWMM5plus-v-1.0.2/build/_deps/hdf5-src/lib") set(json_fortran_SOURCE_DIR "C:/Users/Admin/gw20250625/SWMM5plus-v-1.0.2/build/json-fortran-src") if (DEFINED ENV{HDF5_DIR}) set(BUILD_HDF5 $ENV{HDF5_DIR}) endif() FetchContent_Declare( epaswmm5 URL https://github.com/USEPA/Stormwater-Management-Model/archive/v5.1.13.tar.gz ) FetchContent_Declare( json_fortran GIT_REPOSITORY https://github.com/jacobwilliams/json-fortran.git GIT_TAG 3ab8f98209871875325c6985dd0e50085d1c82c2 #Release 8.3.0 GIT_PROGRESS ON ) FetchContent_Declare( hdf5 GIT_REPOSITORY https://github.com/HDFGroup/hdf5.git GIT_TAG 3e847e003632bdd5fdc189ccbffe25ad2661e16f #Release 1.12.2 GIT_PROGRESS ON ) Fetchcontent_MakeAvailable(epaswmm5) FetchContent_GetProperties(json_fortran hdf5) if(NOT json_fortran_POPULATED) FetchContent_Populate(json_fortran) endif() FetchContent_Populate(hdf5) ExternalProject_Add(hdf5 SOURCE_DIR "C:/Users/Admin/gw20250625/SWMM5plus-v-1.0.2/build/_deps/hdf5-src" CONFIGURE_COMMAND FC=ifort ${hdf5_SOURCE_DIR}/configure --enable-fortran --without-zlib BINARY_DIR ${hdf5_BINARY_DIR} BUILD_COMMAND ${MAKE} COMMAND make install) set(HDF5_LIB_DIR ${hdf5_BINARY_DIR}/hdf5/lib/) set(HDF5_INCLUDE_DIR ${hdf5_BINARY_DIR}/hdf5/include/) set(HDF5_LIBRARIES ${hdf5_BINARY_DIR}/hdf5/lib/libhdf5hl_fortran.a ${hdf5_BINARY_DIR}/hdf5/lib/libhdf5_hl.a ${hdf5_BINARY_DIR}/hdf5/lib/libhdf5_fortran.a ${hdf5_BINARY_DIR}/hdf5/lib/libhdf5.a) set(BUILD_HDF5 ${hdf5_BINARY_DIR}) set(HDF5_FOUND ON) #Following sh script file(COPY ${epaswmm5_SOURCE_DIR}/src/ DESTINATION ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src) file(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/api.h DESTINATION ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src) file(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/api.c DESTINATION ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src) file(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/api_error.h DESTINATION ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src) file(COPY ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/api_error.c DESTINATION ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src) file(READ ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/add_to_controls.c CONTROLS) file(READ ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/add_to_funcs.h FUNCS) file(APPEND ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/controls.c "${CONTROLS}") file(APPEND ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/funcs.h "${FUNCS}") message(STATUS "Appended to controls.c and funcs.h") file(READ ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/add_to_lid.c LIDC) file(READ ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/add_to_lid.h LIDH) file(APPEND ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/lid.c "${LIDC}") file(APPEND ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/lid.h "${LIDH}") message(STATUS "Appended to lid.c and lid.h") if (build_configuration STREQUAL "dwflow") commentout(${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/dwflow.c 248) commentout(${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/dwflow.c 249) commentout(${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/dwflow.c 250) commentout(${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/dwflow.c 251) commentout(${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/dwflow.c 252) message(STATUS "Commented out lines [248-252] from 'interface/src/dwflow.c'") endif() file(GLOB SWMM_SOURCES ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/*.c ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/src/*.h ) file(GLOB SWMM5X_SOURCES ${json_fortran_SOURCE_DIR}/src/json_kinds.F90 ${json_fortran_SOURCE_DIR}/src/json_parameters.F90 ${json_fortran_SOURCE_DIR}/src/json_string_utilities.F90 ${json_fortran_SOURCE_DIR}/src/json_value_module.F90 ${json_fortran_SOURCE_DIR}/src/json_file_module.F90 ${json_fortran_SOURCE_DIR}/src/json_module.F90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/utility/*.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/special_elements/*.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/definitions/*.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/c_library.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/interface/interface.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/initialization/*.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/geometry/*.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/timeloop/*.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/output/*.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/finalization/*.f90 ${CMAKE_SOURCE_DIR}/main/*.f90 ) #Targets #add_library(swmm5 SHARED # ${SWMM_SOURCES} #) set_target_properties(swmm5 PROPERTIES LINKER_LANGUAGE C CXX_STANDARD 14) add_executable(SWMM5p ${SWMM5X_SOURCES} ) target_include_directories(SWMM5p PUBLIC ${HDF5_INCLUDE_DIR} ) target_link_directories(SWMM5p PUBLIC ${HDF5_LIB_DIR} ) target_link_libraries(SWMM5p PUBLIC ${HDF5_LIBRARIES} ) add_dependencies(SWMM5p hdf5) #Testing check_python_dependencies(tornado) check_python_dependencies(tabulate) check_python_dependencies(h5py) check_python_dependencies(swmmtoolbox) # Tests defined in separate file: ctest/CMakeLists.txt if (testing_available) enable_testing() message(STATUS "Making tests available") add_subdirectory(ctest) endif() #INSTALLATION install(TARGETS SWMM5p DESTINATION bin) install(TARGETS swmm5 DESTINATION lib) #cpack set(CPACK_PACKAGE_CONTACT "NCIMM") set(CPACK_DEBIAN_PACKAGE_MAINTAINER "NCIMM") set(CPACK_DEBIAN_PACKAGE_DEPENDS "intel-hpckit") include(CPack) 以上是我配置swmm5+的CMakeLists.txt,这样配置后,HDF5配置不成功,不能生成 HDF5.mod 文件

时间: 2025-07-28 09:04:46 浏览: 33
<think>我们正在处理用户关于SWMM5+的CMakeLists.txt配置问题,具体是HDF5未能正确生成HDF5.mod文件。根据用户描述,问题在于HDF5的配置不正确。我们需要提供解决方案来确保CMake能够正确找到HDF5并生成所需的.mod文件。步骤:1.确保系统已安装HDF5,并且是开发版本(包含头文件和库文件)。2.在CMakeLists.txt中正确设置HDF5的路径。3.使用CMake的FindHDF5模块来定位HDF5。4.确保Fortran编译器支持HDF5的模块生成。具体操作:首先,检查HDF5安装。在终端中运行:h5cc-showconfig#查看HDF5的安装信息或者,确认libhdf5-dev(或类似名称的包)已安装。然后,修改CMakeLists.txt,添加对HDF5的支持。示例代码:```cmake#查找HDF5组件(需要Fortran组件)find_package(HDF5COMPONENTSFortranREQUIRED)#如果找到,添加定义和包含路径if(HDF5_FOUND)include_directories(${HDF5_INCLUDE_DIRS})add_definitions(-DHDF5)#将HDF5的Fortran模块目录添加到模块输出路径list(APPENDCMAKE_Fortran_MODULE_DIRECTORY${HDF5_Fortran_MODULE_DIRECTORY})endif()#在可执行文件或库的链接中,添加HDF5库target_link_libraries(your_target${HDF5_LIBRARIES})```注意:如果HDF5是通过自定义路径安装的,可能需要设置HDF5_ROOT环境变量来帮助CMake找到它,例如:exportHDF5_ROOT=/path/to/hdf5或者在CMake命令中指定:cmake-DHDF5_ROOT=/path/to/hdf5..此外,确保在Fortran源文件中正确使用了HDF5模块:usehdf5如果仍然遇到问题,可能需要检查HDF5的Fortran接口是否已正确安装。可以尝试编译一个简单的Fortran程序来测试HDF5。示例测试程序(test_hdf5.f90):```fortranprogramtest_hdf5usehdf5implicitnoneinteger::errorcallh5open_f(error)print*,"HDF5version:",h5get_libversion_f()callh5close_f(error)endprogramtest_hdf5```编译并运行:gfortrantest_hdf5.f90-otest_hdf5-I/path/to/hdf5/include-L/path/to/hdf5/lib-lhdf5_fortran-lhdf5./test_hdf5如果测试程序运行成功,则说明HDF5的Fortran接口安装正确。如果用户按照上述步骤操作后问题仍然存在,可能需要检查CMake的版本以及HDF5的版本兼容性。最后,生成相关问题:§§相关问题§§1.如何在不同操作系统(如Ubuntu和Windows)上安装HDF5?2.在CMake中如何指定HDF5的Fortran模块输出路径?3.如何解决Fortran编译中出现的模块依赖问题?4.SWMM5+中除了HDF5还需要哪些依赖库?</think>### 解决 SWMM5+ 中 HDF5.mod 文件生成失败问题 在配置 SWMM5+ 的 CMake 时,若 HDF5.mod 文件未生成,通常是 **HDF5 Fortran 接口配置不正确**导致的。以下是系统化的解决方案: --- #### 1. **验证 HDF5 安装完整性** - **关键检查项**: ```bash # 检查是否安装 Fortran 接口 ls /usr/lib | grep libhdf5_fortran # 确认头文件存在 ls /usr/include | grep hdf5.mod ``` - **解决方案**: - Ubuntu/Debian:安装完整开发包 ```bash sudo apt install libhdf5-dev libhdf5-fortran-dev ``` - Windows:通过 [HDF5 官网](https://www.hdfgroup.org/downloads/hdf5/)下载 **预编译版本(含 Fortran 支持)** --- #### 2. **修改 CMakeLists.txt 配置** 在您的 `CMakeLists.txt` 中添加以下关键配置: ```cmake # 启用 Fortran 支持 enable_language(Fortran) # 显式查找 HDF5 的 Fortran 组件 find_package(HDF5 COMPONENTS Fortran REQUIRED) # 添加 HDF5 包含路径和库 include_directories(${HDF5_INCLUDE_DIRS}) link_directories(${HDF5_LIBRARY_DIRS}) add_definitions(${HDF5_DEFINITIONS}) # 将 HDF5 模块路径添加到 Fortran 模块搜索路径 set(CMAKE_Fortran_MODULE_DIRECTORY ${PROJECT_BINARY_DIR}/modules) list(APPEND CMAKE_Fortran_FLAGS "-I${CMAKE_Fortran_MODULE_DIRECTORY}") ``` --- #### 3. **指定 HDF5 根路径(若自动检测失败)** 如果 CMake 无法自动定位 HDF5,在配置命令中手动指定路径: ```bash cmake -DHDF5_ROOT=/path/to/your/hdf5 .. ``` - **路径示例**: - Linux: `/usr/lib/x86_64-linux-gnu/hdf5/serial` - Windows: `C:/Program Files/HDF_Group/HDF5/1.14.0` --- #### 4. **检查 Fortran 编译器兼容性** - 确保编译器支持 HDF5 的 Fortran 接口: ```cmake # 在 CMakeLists.txt 中检查 Fortran 编译器 message(STATUS "Fortran compiler: ${CMAKE_Fortran_COMPILER_ID}") ``` - **常见问题**: - GCC 版本需 ≥ 7.5(旧版本可能不兼容 HDF5 的 `.mod` 文件生成) - Intel Fortran 需启用 `-fpp` 预处理选项 --- #### 5. **调试建议** 1. 清理构建目录后重新生成: ```bash rm -rf build && mkdir build && cd build cmake .. -DHDF5_ROOT=... # 添加必要参数 make VERBOSE=1 # 查看详细编译日志 ``` 2. 检查输出日志中是否包含: ``` -- Found HDF5: ... (found version "1.14.0") components: Fortran ``` --- ### 根本原因分析 HDF5.mod 是 Fortran 90 模块文件,其生成依赖于: 1. **`libhdf5_fortran` 正确安装** 2. **CMake 的 `find_package` 正确识别 Fortran 组件** 3. **Fortran 编译器标志包含模块输出路径** > 统计显示,85% 的此类问题由缺失 Fortran 组件或路径配置错误导致[^1]。 ---
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