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新Python库ldsc2发布,解压缩即可使用

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5星 · 超过95%的资源 | 7KB | 更新于2024-11-14 | 30 浏览量 | 1 下载量 举报 收藏
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从提供的信息中,我们可以提取以下知识点: 1. Python库概念:Python库是一系列预先编写好的函数、类和方法的集合,它们被设计为执行特定任务或解决特定问题。Python库可以是标准库的一部分,也可以是第三方库。标准库随Python解释器一起安装,而第三方库则需要单独安装。 2. wheel文件格式:ldsc2-0.0.23-py3-none-any.whl 文件是一个wheel格式的文件,这是一种Python的二进制安装包格式。Wheel文件的目的是加快安装过程,因为它们不需要像源代码安装那样进行编译。wheel文件通过预先编译来提高安装效率,并且可以存储在Python包索引(PyPI)中,以供用户下载和安装。 3. Python版本兼容性:文件名中的 "py3" 指的是该库兼容Python 3.x版本。"none" 表明该库没有特定的操作系统要求,这意味着它可以跨平台运行在不同的操作系统上。"any" 通常表示该库没有对Python的特定实现有要求,可以被任何兼容的Python解释器所使用。 4. Python库命名惯例:文件名 "ldsc2-0.0.23" 暗示了库的名称以及其版本号。"ldsc2" 可能是库的简称,而 "0.0.23" 则表示这是该库的第23个版本。版本号通常遵循主版本号.次版本号.修订号的格式,其中每个部分的增加都代表了不同的更新内容或重要性。 5. 文件后缀解释:".whl" 文件后缀表示该文件是一个wheel格式的Python包。用户可以使用pip(Python的包管理工具)来安装这个包,安装命令通常是 "pip install [包名]"。 6. 文件的可执行性:虽然标题和描述中提到“解压后可用”,但这通常是指用户需要先通过pip工具安装该whl文件,而不是手动解压。pip会负责将wheel文件中的内容安装到Python环境中,使其变成可执行的Python库。 7. 开发语言的相关性:由于标签中提到了 "python 开发语言 后端 Python库",可以推断出ldsc2库是用于后端开发的Python库。后端开发通常指的是服务器端的开发,涉及到数据库交互、业务逻辑处理和API的实现等。 8. 技术栈的应用:后端开发涉及的技术栈可能包括数据库技术(如SQLite、MySQL、PostgreSQL等)、网络协议(如HTTP、TCP/IP)、Web框架(如Django、Flask等)以及缓存系统等。如果ldsc2是一个专门设计用于后端开发的库,那么它可能会涉及到这些技术栈中的某些方面。 9. Python库的维护与更新:文件名中的版本号 "0.0.23" 表明这并不是一个全新的库,而是一个持续迭代的产品。库的维护者会基于用户反馈、bug报告和新功能的需求来定期更新库的内容。 10. 版本控制的重要性:版本控制是软件开发中不可或缺的部分,它不仅帮助用户了解库的更新历史,还能确保用户在升级到新版本时的兼容性和稳定性。 通过以上知识点的提取,我们可以对Python库 "ldsc2-0.0.23-py3-none-any.whl" 有一个全面的认识。了解这些信息对于开发者来说是非常重要的,可以帮助他们更好地管理和使用Python库,以及解决在实际开发过程中可能遇到的问题。

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(ldsc) bio2230@Bioinfo1-Workstation-1:~/ldsc/ldsc/FinnGen$ python /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/ldsc.py --h2 /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/FinnGen/finngen_R5_C3_BREAST_EXALLC.sumstats.gz --ref-ld-chr /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/chr/ --w-ld-chr /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/chr/ --out breast_h2 ********************************************************************* * LD Score Regression (LDSC) * Version 1.0.1 * (C) 2014-2019 Brendan Bulik-Sullivan and Hilary Finucane * Broad Institute of MIT and Harvard / MIT Department of Mathematics * GNU General Public License v3 ********************************************************************* Call: ./ldsc.py \ --h2 /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/FinnGen/finngen_R5_C3_BREAST_EXALLC.sumstats.gz \ --ref-ld-chr /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/chr/ \ --out breast_h2 \ --w-ld-chr /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/chr/ Beginning analysis at Fri Mar 14 16:33:17 2025 Reading summary statistics from /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/FinnGen/finngen_R5_C3_BREAST_EXALLC.sumstats.gz ... Read summary statistics for 1162423 SNPs. Reading reference panel LD Score from /f/student/22/2230/ldsc/ldsc/chr/[1-22] ... (ldscore_fromlist) Traceback (most recent call last): File "/f/student/22/2230/ldsc/ldsc/ldsc.py", line 644, in <module> sumstats.estimate_h2(args, log) File "/f/student/22/2230/ldsc/ldsc/ldscore/sumstats.py", line 326, in estimate_h2 args, log, args.h2) File "/f/student/22/2230/ldsc/ldsc/ldscore/sumstats.py", line 243, in _read_ld_sumstats ref_ld = _read_ref_ld(args, log) File "/f/student/22/2230/ldsc/ldsc/ldscore/sumstats.py", line 82, in _read_ref_ld 'reference panel LD Score', ps.ldscore_fromlist) File "/f/student/22/2230/ldsc/ldsc/ldscore/sumstats.py", line 152, in _read_chr_split_files out = parsefunc(_splitp(chr_arg), _N_CHR, **kwargs) File "/f/student/22/2230/ldsc/ldsc/ldscore/parse.py", line 103, in ldscore_fromlist y = ldscore(fh, num) File "/f/student/22/2230/ldsc/ldsc/ldscore/parse.py", 请帮我解决以上报错

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