Itinatag ang pamahalaang militar ng mga Amerikano sa Pilipinas sa ilalim ni Heneral Wesley Meritt upang mapadali ang pagsasaayos at pagpapayapa matapos ang kaguluhan dulot ng pakikipaglaban ng mga Pilipino. Ang Komisyong Schurman at Komisyong Taft ay itinatag upang suriin ang kalagayang panlipunan at magmungkahi ng mga patakaran para sa pamahalaang sibilyan. Sa mga kilusang propaganda, kinilala ang mga bayani tulad nina José Rizal, Marcelo H. del Pilar, at Graciano López Jaena na nagtulungan upang labanan ang mga pang-aabuso ng mga Espanyol.